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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002708`

染色体: Chr07 坐标: 26466911-26475446 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002708`
名称	SmilChr07G002708
描述	uncharacterized SmilChr07G002708
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	26466911 - 26475446 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994018`
GeneID	`130994018`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994018`
原始查询	`SmilChr07G002708`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=29.4; qcov=0.252; evalue=2.93e-44; confidence=weak
Rice	`Os06g0484800` - identity=29; qcov=0.518; evalue=1.3e-110; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994018

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775038.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057775038.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057775038.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775038.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775038.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:26466953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr7:26466981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B99,D10
`Chr7:26466990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B99,D10
`Chr7:26467010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:26467012`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	43	A2,A5,B100,B104,B120,B123,B125,B129,B130,B135,B137,B138,B31,B37,B42,B43,B48,B52,B68,B71,B8,B80,B84,B86,B89,B95,B98,C13,C17,C24,C36,C48,C50,C57,C58,C61,C62,C72,C80,C85,C86,D11,D4
`Chr7:26467029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:26467032`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	78	A1,A16,A19,A4,A5,A8,B100,B102,B103,B11,B110,B113,B117,B118,B124,B129,B131,B134,B139,B16,B17,B19,B23,B28,B3,B31,B4,B40,B41,B42,B43,B49,B5,B51,B55,B57,B58,B6,B63,B65,B69,B74,B76,B77,B78,B8,B83,B88,B97,B98,C11,C12,C14,C20,C25,C27,C30,C34,C37,C41,C42,C43,C51,C56,C60,C64,C66,C67,C69,C70,C71,C73,C75,C87,D1,D2,D4,D8
`Chr7:26467051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr7:26467082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,D10
`Chr7:26470493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr7:26470501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B51,B86,B94
`Chr7:26470517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B84,C60,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775038.1

1606 aa

803

1606

RVT_1

zf-RVT

RVT_3

PF00078 RVT_1 489-750 aa PF13966 zf-RVT 1014-1086 aa PF13456 RVT_3 1195-1249 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775038.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	489	750	9e-29	101.5	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057775038.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	1014	1086	1.6e-14	55.0	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057775038.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	1195	1249	5.7e-05	23.7	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919055.1
ATGACGGATGAATCCAAGAGGCTTCTCAAGGAACATTGTAGTTCCTTCTCTCCCATCCTTTTGGGTCTTCTTGAGCCTAAAAAGGCCTTTCATAAAGTTCAGCATTCCTTCTGGACTTCTCTTAATCTTATTCCGATTCATCAAAACTGTCGTGGACACAGATGCTCCAATATTTGGGTCCTTTCTCACCCCTCGGTGGTTTCAAATACGGTTTATTCTTCTGACCATGTGGTGGTGGTCGATTGCTTTTGGCAATCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994018
ATGACGGATGAATCCAAGAGGCTTCTCAAGGAACATTGTAGTTCCTTCTCTCCCATCCTTTTGGGTCTTCTTGAGCCTAAAAAGGCCTTTCATAAAGTTCAGCATTCCTTCTGGACTTCTCTTAATCTTATTCCGATTCATCAAAACTGTCGTGGACACAGATGCTCCAATATTTGGGTCCTTTCTCACCCCTCGGTGGTTTCAAATACGGTTTATTCTTCTGACCATGTGGTGGTGGTCGATTGCTTTTGGCAATCAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775038.1
MTDESKRLLKEHCSSFSPILLGLLEPKKAFHKVQHSFWTSLNLIPIHQNCRGHRCSNIWVLSHPSVVSNTVYSSDHVVVVDCFWQSMNFRVAFVHGANDQISRRSLWQDLLRFVSGNTVFIGDFNAVKGAHERISAVAPHRGSCVDFCSFIDDTQFIESPTDGLRFTWSGRRFLPHHVESMLDRAMFSQGFANFWDSITTTALPRLSSDHSPLVMQCRRATPSGKRQFRFLNMWVTHSSFGEMVGASWMRTVDALCPIVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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