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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002711`

染色体: Chr07 坐标: 26539490-26541735 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002711`
名称	SmilChr07G002711
描述	aldehyde oxidase GLOX
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	26539490 - 26541735 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995722`
GeneID	`130995722`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995722`
原始查询	`SmilChr07G002711`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aldehyde oxidase GLOX
产物	aldehyde oxidase GLOX
Arabidopsis	`AT1G14430` (AT1G14430) glyoxal oxidase-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838005] identity=58.8; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0258900` - identity=50.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07250 (Glyoxal_oxid_N); PF09118 (GO-like_E_set)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995722

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057777101.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777101.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777101.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777101.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777101.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:26539817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C61
`Chr7:26539947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:26540062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr7:26540104`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B40
`Chr7:26540104`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B40
`Chr7:26540106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr7:26540324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B70,C40,C55
`Chr7:26540477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,C57,D4
`Chr7:26540846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr7:26540874`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B73,C7,C76
`Chr7:26540874`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B73,C7,C76
`Chr7:26540917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B21,C26,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777101.1

545 aa

272

545

Glyoxal_oxid_N

GO-like_E_set

PF07250 Glyoxal_oxid_N 44-429 aa PF09118 GO-like_E_set 438-544 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777101.1`	Pfam	`PF07250`	Glyoxal_oxid_N	Repeat	44	429	3e-182	606.2	Glyoxal oxidase N-terminus
`XP_057777101.1`	Pfam	`PF09118`	GO-like_E_set	Domain	438	544	1.6e-29	102.9	Galactose oxidase-like, Early set domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921118.1
GGCAAATAAATTATGAGTCCAACTGAATATGGTAATAACGGTTGGTGAATAAACCAGTTTTCTGCTGCGAGTGATGCTGATTTCAGCAAGATATTAGTAAGAAAGAGAGAGATGAAAATTTACAAAAATACACGATTTCTAAAGTTCGAAAGTGTGAAAAAAAAAAAAAAGTAAATCGCATTGTGTTTGATATTTTATCTTGACTGCTGAATGATTGCCAATCAAAAATAAAAATTTATTAAAAGGGAATTAATAAATTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995722
ATGGCATCTCCATCTCTTACTTTCTCTCTCATTCTGGCTATCTCTCTCTTGACTCTGTGTTGGTCATACCCATTCCGGCGCGGCGGCGGAACATGGAAAGTCCTACACAGATCGGTGGGCATCTCGGCCATGCACATGCAGCTCTTCCACAACAACAAGGTGATGATCTTCGACCGCACCGATTTCGGGCCCTCCCAAGTAACCCTCCCCTTCGGCAAATGCCGCCACAACGACGAAGCCATTTCCGAGGACTGCACGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777101.1
MASPSLTFSLILAISLLTLCWSYPFRRGGGTWKVLHRSVGISAMHMQLFHNNKVMIFDRTDFGPSQVTLPFGKCRHNDEAISEDCTAHSILYDVASNTFRPLMVQTNVWCSSGALDSHGALIQTGGYHAGDHKVRTFTPCDDELCDWIELPQNLTVQRWYASDHILPDGRLIIVGGRKAFSYEFFPKNLQESVFYFSFLSETTDPGEENNLYPFLHLLPDGNLFVFANQRSVLLDYKRNQVLREFPPIPGEKRSYPATGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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