当前解析结果
SmilChr07G002739| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002739 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002739 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002739 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 26895394 - 26896312 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995751 |
|---|---|
| GeneID | 130995751 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995751 |
| 原始查询 | SmilChr07G002739 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837996]; symbol=AT1G14345; hit=AT1G14345; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837996]; symbol=AT1G14345; hit=AT1G14345; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT1G14345 (AT1G14345)NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837996] identity=81.4; qcov=0.686; evalue=7.66e-79; confidence=high |
| Rice | Os03g0170500 (OSJNBa0091P11.4)- identity=77.9; qcov=0.601; evalue=6.93e-47; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03703 (bPH_2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995751 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057777140.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 1.00000 | XP_057777140.1 |
| 3 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.80000 | XP_057777140.1 |
| 4 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 0.40000 | XP_057777140.1 |
| 5 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.20000 | XP_057777140.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:26895629 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B14,C77,C83 |
Chr7:26895755 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A11,A21,B101,B128,C61 |
Chr7:26896093 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B126,B135,C16,C33,D11 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057777140.1PF03703
bPH_2 76-173 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057777140.1 |
Pfam | PF03703 |
bPH_2 | Domain | 76 | 173 | 9.7e-14 | 52.3 | Bacterial PH domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。