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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002751`

染色体: Chr07 坐标: 27041988-27045743 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002751`
名称	SmilChr07G002751
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP23
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	27041988 - 27045743 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995761`
GeneID	`130995761`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995761`
原始查询	`SmilChr07G002751`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP23
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP23
Arabidopsis	`AT1G26940` (AT1G26940) Cyclophilin-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839584] identity=77.8; qcov=0.898; evalue=2.8e-128; confidence=high
Rice	`Os11g0602900` (OsCYP23) - identity=74; qcov=0.846; evalue=5.92e-117; confidence=high
GO	GO:0000413 (protein peptidyl-prolyl isomerization); GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00160 (Pro_isomerase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995761

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057777152.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057777152.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057777152.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777152.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777152.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:27042345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr7:27042353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B85,B96
`Chr7:27043723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr7:27043925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr7:27044349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B86,C17
`Chr7:27045497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B31,C72
`Chr7:27045615`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	35	A11,A21,A3,A9,B102,B11,B111,B126,B127,B13,B135,B17,B25,B30,B35,B46,B49,B53,B59,B60,B77,B79,C14,C15,C16,C30,C33,C36,C37,C4,C46,C47,C61,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777152.1

246 aa

123

246

Pro_isomerase

PF00160 Pro_isomerase 54-206 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777152.1`	Pfam	`PF00160`	Pro_isomerase	Domain	54	206	1.1e-33	117.5	Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921169.1
TTACGGCCCACTGGTCAAGTAAGTTTTTCGTTTACTTTAGATGGGCCAAACCTAGTTGGGCCGACGGTGGTTCCCTACGCTTAACATATTGTACTTTTGTGAACTTGGATGTGCTCGAACACACACACTGACACACAAAGAGCACCAACGTCAACGAAAATGAGCGGTAATCAGGTGATCTTGATCCTCATTTCGATGGTTTGCATGGGCGCATTCCGCGGTTCCATCACTGCAATTGCTACAGTTCCTGAATTGGGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995761
ATGTGCTCGAACACACACACTGACACACAAAGAGCACCAACGTCAACGAAAATGAGCGGTAATCAGGTGATCTTGATCCTCATTTCGATGGTTTGCATGGGCGCATTCCGCGGTTCCATCACTGCAATTGCTACAGTTCCTGAATTGGGATCGGCTCGTGTCTTATTTCAGACAAATTATGGGGACATAGAGTTTGGTTTCTATCACAGTGTTGCACCAAAGACGGTTGAACACATTTTCAAGCTTGTTCGGTTGGGATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777152.1
MCSNTHTDTQRAPTSTKMSGNQVILILISMVCMGAFRGSITAIATVPELGSARVLFQTNYGDIEFGFYHSVAPKTVEHIFKLVRLGCYNTNHFFRVDKGFVAQVADVAGGRTAPMNEVQKLEAEKTIVGEFSDVKHVRGILSMGRYSDPDSAQSSFSILLGDAPHLDGQYAIFGKVTKGDETLRKLEEVPTRKEGIFVMPTERITIFSTYYYDTETESCEDDRLVLKRRLLASAIEIEKQRMKCFP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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