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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002752`

染色体: Chr07 坐标: 27127653-27128786 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002752`
名称	SmilChr07G002752
描述	uncharacterized SmilChr07G002752
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	27127653 - 27128786 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994024`
GeneID	`130994024`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994024`
原始查询	`SmilChr07G002752`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832006]; symbol=AT5G18880; hit=AT5G18880; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832006]; symbol=AT5G18880; hit=AT5G18880; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G18880` (AT5G18880) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832006] identity=23.6; qcov=0.639; evalue=2.17e-09; confidence=weak
Rice	`Os01g0930300` - identity=20.8; qcov=0.536; evalue=2.42e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994024

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775044.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057775044.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775044.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775044.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775044.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:27127663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	31	A9,B108,B111,B12,B123,B134,B136,B14,B21,B25,B33,B34,B4,B41,B55,B61,B77,B94,B95,B98,C14,C17,C21,C22,C33,C41,C42,C47,C5,C72,D2
`Chr7:27127667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B140,B57,C29,C82
`Chr7:27127669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	168	A1,A10,A13,A18,A19,A2,A20,A22,A23,A24,A25,A5,A6,A7,A8,B1,B10,B100,B102,B103,B105,B106,B107,B11,B110,B112,B113,B114,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B127,B129,B131,B132,B133,B134,B137,B138,B139,B140,B15,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B23,B27,B28,B29,B3,B31,B35,B36,B38,B39,B40,B44,B45,B47,B48,B5,B51,B53,B54,B55,B56,B63,B64,B65,B67,B69,B7,B71,B72,B74,B75,B76,B77,B78,B8,B81,B82,B83,B84,B86,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B97,C1,C10,C12,C13,C14,C15,C17,C18,C19,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C28,C31,C34,C37,C38,C39,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C53,C56,C58,C59,C6,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C7,C70,C71,C72,C74,C76,C80,C82,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr7:27127680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B129,B18
`Chr7:27127685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr7:27127706`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B111,B140,B50,B57,C29,C82
`Chr7:27127708`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B111,B140,B50,B57,C29,C82
`Chr7:27127732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C46
`Chr7:27127761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,A18,B108,B81
`Chr7:27127794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B74
`Chr7:27127795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr7:27127817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775044.1

377 aa

188

377

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 147-221 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775044.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	147	221	2.3e-13	51.3	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919061.1
ATGGCGTGGAAAGTCATTGAAGGAAATAGCTTTGGTTATGACATTATGAAACAGCGATATTTGAATCAATGCTGTCAGGTGAACAGCGTGGCCCCCTCAACGGTCTGGATAGGGCTAAGGGAGGAGATTGGGGAGCTGGTCTCGAACTCGTTTAGCTATATTGGTGACGGTACGTCAACTCTTTTCTGGCTTGATGATTGGCTTGGATATCTGTTGGTGGATAAATGTGGAGTTCCTTTCTTTATGAGAGATTCTCTTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994024
ATGGCGTGGAAAGTCATTGAAGGAAATAGCTTTGGTTATGACATTATGAAACAGCGATATTTGAATCAATGCTGTCAGGTGAACAGCGTGGCCCCCTCAACGGTCTGGATAGGGCTAAGGGAGGAGATTGGGGAGCTGGTCTCGAACTCGTTTAGCTATATTGGTGACGGTACGTCAACTCTTTTCTGGCTTGATGATTGGCTTGGATATCTGTTGGTGGATAAATGTGGAGTTCCTTTCTTTATGAGAGATTCTCTTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775044.1
MAWKVIEGNSFGYDIMKQRYLNQCCQVNSVAPSTVWIGLREEIGELVSNSFSYIGDGTSTLFWLDDWLGYLLVDKCGVPFFMRDSLTQTVADYFFEGVWHFTQTFVNSFPQIVCDILLLPIGGKDARFWKPSLQGKVSSVLAFAHHGHKFPRVSWGSWIWEPFIPVRRSLVCWRLLHDRMPNYDRLIRHGLVAPNWCPICKRDAETAEHIFWNCVCVQQAWAIFLTWFDFSQGLQELDIHSFLVAAWNRQLSSQISMLWK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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