Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002756`

染色体: Chr07 坐标: 27323513-27325084 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002756`
名称	SmilChr07G002756
描述	uncharacterized SmilChr07G002756
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	27323513 - 27325084 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995765`
GeneID	`130995765`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995765`
原始查询	`SmilChr07G002756`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995765

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777158.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057777158.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777158.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777158.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777158.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:27323618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr7:27323740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B108
`Chr7:27323745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B108
`Chr7:27323768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B129
`Chr7:27323773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B32,B38,B39,C39,C43,C44,C54,C85
`Chr7:27323790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,C40,C58
`Chr7:27323822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:27323937`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A8,B113,B114,B25,B27,B34,B35,B38,B55,B58,B68,C19,C22,C54,C59,C74,C82,C85,D9
`Chr7:27324716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B139,C3,D3
`Chr7:27324716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,C3,D3
`Chr7:27324718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921175.1
ACCGCAAGTAGGGTTTGCTTTCTCCAAAAACATTACCGCCGCAAGCCGTTTGCTTTCTCCAAAAAAATTACCGCCGCAAGCCGTCTCCCTTCGCCTCGCCGTCTTCGCCATCTCCGCCTCGCCATCTCTCTGTCACCTCTCGCCGTCTCCCTCTCGTCTGTTGTCGTCTCCCTCTCGCCTTTCAACAAAGTCAAGCTTTCAACCAGCGAACTCAGGCTCTGAATGAGCTCAGCCTCTCAGATCCTCGCCGGCTCCGTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995765
ATGGATGCACCGCAGGAGGAGAATTCTAATTATTTGAGGCCGAGTACAATTAATGTGGCTTCAAATGTTGGGACATATTACAAGACAAAATACTTGAAAATGGTTAGGAAGGTATTGAATGCGAAATGTGGTCAACCGTTGGTGGACAGATTTTTAAGTGGTTGTTTCGGACACTTATTAGATTGGAATCCGGGGTCAAAGTGTGCTATGGCTGTTCACCATGTAGTTTCTCGCCAAATCCGATCAAATGATAATGGATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777158.1
MDAPQEENSNYLRPSTINVASNVGTYYKTKYLKMVRKVLNAKCGQPLVDRFLSGCFGHLLDWNPGSKCAMAVHHVVSRQIRSNDNGLWSFINGSRLNFSERDYALVRGLNFGETDFDTRAHHDLRNVEVFRKFCCGQRTEFWRN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器