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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002780`

染色体: Chr07 坐标: 27695816-27703373 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002780`
名称	SmilChr07G002780
描述	mitochondrial Rho GTPase 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	27695816 - 27703373 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995791`
GeneID	`130995791`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995791`
原始查询	`SmilChr07G002780`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial Rho GTPase 1
产物	mitochondrial Rho GTPase 1
Arabidopsis	`AT5G27540` (MIRO1) MIRO-related GTP-ase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832814] identity=70.6; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0810600` (OSJNBa0028F23.7) - identity=69.7; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005741 (mitochondrial outer membrane); GO:0007005 (mitochondrion organization); GO:0007264 (small GTPase-mediated signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF00071 (Ras); PF08355 (EF_assoc_1); PF08356 (EF_assoc_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995791

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057777196.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.60000	`XP_057777196.1`
3	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.60000	`XP_057777196.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057777196.1`
5	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057777196.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:27697939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr7:27698198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,A18,B8
`Chr7:27698323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr7:27698359`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr7:27700105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B121,B25,B30,B85
`Chr7:27701393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C76
`Chr7:27702031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr7:27702762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr7:27702923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B90,B92,C21,C4,C60
`Chr7:27703088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B48,B66,D5
`Chr7:27703107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777196.1

646 aa

323

646

Ras

EF_assoc_2

EF_assoc_1

Ras

PF00071 Ras 17-178 aa PF08356 EF_assoc_2 232-316 aa PF08355 EF_assoc_1 353-421 aa PF00071 Ras 430-550 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777196.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	17	178	5.2e-20	72.4	Ras family
`XP_057777196.1`	Pfam	`PF08356`	EF_assoc_2	Family	232	316	1.5e-31	108.9	EF hand associated
`XP_057777196.1`	Pfam	`PF08355`	EF_assoc_1	Family	353	421	4.7e-22	78.1	EF hand associated
`XP_057777196.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	430	550	5.2e-20	72.4	Ras family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921213.1
CCGACCTAAAAAAATTGTTTCAATTTACCTGTTCCTATTTGCTGTCATCTCCGCCGTCCGATCAAATCAGAGACGTCATCTCCTTCTCGATTCCTAAGCTCCACCTTAAACCCTTGGAGCACAGGTTCTAGACAGAGAAACCCTCTCTTCTCTCTCTTCCTTCCAGTTTCCCCTACTGCAAGCGGTGATTGTAAATGGCGGGAGGTGCTCCGGCTGCTGCTGGTGGGGCGGGGAATGGTGTAAGAATTGTGGTTGCCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995791
ATGGCGGGAGGTGCTCCGGCTGCTGCTGGTGGGGCGGGGAATGGTGTAAGAATTGTGGTTGCCGGCGACGCAAAGTCGGGAAAATCGAGTTTGATTGTCACGGCAGCTGCTGAAAACTTTCCGACCAATGTCCCACCGGTGCTGCCGCCTACGAGGCTCCCCGTGGACTTGTACCCGGAACGTGTTCCTGTCACCATTATTGATACTTCGTCCAGTCCTGAAAATAGGGACAGGCTAGTTGAAGACCTTACAAGGGCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777196.1
MAGGAPAAAGGAGNGVRIVVAGDAKSGKSSLIVTAAAENFPTNVPPVLPPTRLPVDLYPERVPVTIIDTSSSPENRDRLVEDLTRADAVVLTYACDRPETLDRLSTHWLPELRRLEVKVPVIVVGCKLDKRGDQQPVSLEQVMSPIMQQFREIETCIECSASNHIQIPEVFYYAQKAVLHPTAPLFDQEQQVLKPRCVRALKRIFILCDHDRDGALSDAELNDFQVKCFNAPLQASEIVGVKRVVQEKLREGVDDRGLTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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