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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002786`

染色体: Chr07 坐标: 27761463-27762145 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002786`
名称	SmilChr07G002786
描述	E3 ubiquitin-protein ligase MPSR1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	27761463 - 27762145 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995825`
GeneID	`130995825`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995825`
原始查询	`SmilChr07G002786`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin-protein ligase MPSR1-like
产物	E3 ubiquitin-protein ligase MPSR1-like
Arabidopsis	`AT1G26800` (AT1G26800) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839223] identity=50.3; qcov=1.03; evalue=2.74e-52; confidence=high
Rice	`Os07g0631200` (P0519E12.104) - identity=43.1; qcov=0.641; evalue=8.88e-23; confidence=medium
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF13445 (zf-RING_UBOX); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995825

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777259.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057777259.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057777259.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777259.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777259.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:27761927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B58,C12,C37,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777259.1

181 aa

181

zf-RING_2

zf-RING_11

zf-C3HC4_2

zf-RING_UBOX

zf-C3HC4

PF13639 zf-RING_2 103-143 aa PF17123 zf-RING_11 104-129 aa PF13923 zf-C3HC4_2 104-142 aa PF13445 zf-RING_UBOX 105-132 aa PF00097 zf-C3HC4 105-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777259.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	103	143	2.6e-13	50.7	Ring finger domain
`XP_057777259.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	104	129	1.9e-06	28.2	RING-like zinc finger
`XP_057777259.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	104	142	1.3e-10	41.6	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057777259.1`	Pfam	`PF13445`	zf-RING_UBOX	Domain	105	132	6.2e-06	26.8	RING-type zinc-finger
`XP_057777259.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	105	142	1.5e-09	38.2	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921276.1
ATGGCTTCAGAGCCCTCATCCTTGATCGAAAACCTAATCAATTCGAGAAACAGAGACATCTCCCTCTTCCTGCCCTTCATCATCGGCCTAAACGCCGCGGCGGAGGATCCGCCTGACCGGATCGTGCTCATCAACCCCTTCACGCAGGGGATGGTAGTGATCGAGAGAAGAAGCAGCGATAACAACAGCTCGTCAGCTTTCGAGTCTTTGCTTGATGAATTGTTCTCTCGCAAGAGCGGTCGGCCGCCGGCGTCGAAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995825
ATGGCTTCAGAGCCCTCATCCTTGATCGAAAACCTAATCAATTCGAGAAACAGAGACATCTCCCTCTTCCTGCCCTTCATCATCGGCCTAAACGCCGCGGCGGAGGATCCGCCTGACCGGATCGTGCTCATCAACCCCTTCACGCAGGGGATGGTAGTGATCGAGAGAAGAAGCAGCGATAACAACAGCTCGTCAGCTTTCGAGTCTTTGCTTGATGAATTGTTCTCTCGCAAGAGCGGTCGGCCGCCGGCGTCGAAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777259.1
MASEPSSLIENLINSRNRDISLFLPFIIGLNAAAEDPPDRIVLINPFTQGMVVIERRSSDNNSSSAFESLLDELFSRKSGRPPASKAAIDAMESVEAVGGEDNQCAICLEEWEKAKRMPCKHSFHGECIENWLNIHGSCPICRYEMPVDGAEDEKKRRGIWVSFAVGGERRSGESDDDDSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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