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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002819`

染色体: Chr07 坐标: 28234733-28236345 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002819`
名称	SmilChr07G002819
描述	F-box protein At5g49610-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	28234733 - 28236345 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995804`
GeneID	`130995804`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995804`
原始查询	`SmilChr07G002819`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At5g49610-like
产物	F-box protein At5g49610-like
Arabidopsis	`AT5G49610` (AT5G49610) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835023] identity=24.2; qcov=0.723; evalue=3.76e-12; confidence=weak
Rice	`Os12g0128000` (OsFbox638) - identity=24.5; qcov=0.628; evalue=2.19e-11; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF24750 (b-prop_At3g26010-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995804

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777216.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057777216.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057777216.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777216.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777216.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:28235648`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B107,B108,B119,B122,B29,B81,D9
`Chr7:28235649`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B51
`Chr7:28235649`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B51
`Chr7:28235650`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B107,B108,B119,B122,B29,B81,D9
`Chr7:28235653`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B51
`Chr7:28235653`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B51
`Chr7:28235692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr7:28235892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C81
`Chr7:28235963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:28236047`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A16,B128
`Chr7:28236047`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A16,B128
`Chr7:28236054`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777216.1

462 aa

231

462

F-box

b-prop_At3g26010-like

PF00646 F-box 93-121 aa PF24750 b-prop_At3g26010-like 171-413 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777216.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	93	121	8.8e-07	29.3	F-box domain
`XP_057777216.1`	Pfam	`PF24750`	b-prop_At3g26010-like	Repeat	171	413	8.6e-18	65.2	F-box protein At3g26010-like, beta-propeller

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921233.1
CCTCAATTAAAACGTTTGAATTCCCCTATTTTAATCACAGATAAATGCTCCGTCAACCGCTGCATCCGGTTAGACCTGCTTCTTTTTCTCTAAAATCTAGAATACTTTTACAAAGCATACACAATCAGATCTCAAAACTGAAAATCCGAATTCTGTGCAGGAATCCTAGCCTCTCTCTCAATATTATTACAAATACCACAGCAAACCACAAACACAAGATCACGTCGATTGCAGCAGTGTTTCTGAATAGTTTGTCTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995804
ATGCTCCGTCAACCGCTGCATCCGGTTAGACCTGCTTCTTTTTCTCTAAAATCTAGAATACTTTTACAAAGCATACACAATCAGATCTCAAAACTGAAAATCCGAATTCTGTGCAGGAATCCTAGCCTCTCTCTCAATATTATTACAAATACCACAGCAAACCACAAACACAAGATCACGTCGATTGCAGCAGTGTTTCTGAATAGTTTGTCTGAAAACGATCATCTTCCTTCATCACCATCTCAGAAAAAAAAAAAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777216.1
MLRQPLHPVRPASFSLKSRILLQSIHNQISKLKIRILCRNPSLSLNIITNTTANHKHKITSIAAVFLNSLSENDHLPSSPSQKKKKTMETNIELPDDIVTEILMKLPVKSVYKFKCVSKKWLWLTSDASFKSHLIPRAPPLMFIFQLQNFESATSFVCADRNLEKLSSAFPRPPSTGMKVASTANDLILYESEHGHEVANPFTGQRVRLPMGKGKGAAASPKAGLIAYTDEKGAVRSYIVVRIVMRDYDNRHTRIQIFSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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