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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002820`

染色体: Chr07 坐标: 28241982-28245220 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002820`
名称	SmilChr07G002820
描述	uncharacterized SmilChr07G002820
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	28241982 - 28245220 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995831`
GeneID	`130995831`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995831`
原始查询	`SmilChr07G002820`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal L32p protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839215]; symbol=AT1G26740; hit=AT1G26740; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Ribosomal L32p protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839215]; symbol=AT1G26740; hit=AT1G26740; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G26740` (AT1G26740) Ribosomal L32p protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839215] identity=54.4; qcov=0.977; evalue=4.7e-34; confidence=medium
Rice	`Os10g0407100` (OSJNBa0060A14.18) - identity=67.2; qcov=0.477; evalue=8.99e-22; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005762 (mitochondrial large ribosomal subunit); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01783 (Ribosomal_L32p)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995831

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057777267.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.80000	`XP_057777267.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057777268.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777267.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777267.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:28242156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr7:28242261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr7:28242264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C38
`Chr7:28242279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr7:28244569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,C38,D11
`Chr7:28244572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B104
`Chr7:28244572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:28244588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr7:28244601`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	128	A1,A11,A14,A18,A19,A20,A21,A24,A5,A6,A7,A8,B101,B103,B105,B106,B109,B11,B111,B113,B115,B119,B12,B120,B122,B123,B124,B126,B127,B128,B130,B132,B134,B135,B139,B14,B15,B18,B20,B21,B25,B27,B31,B32,B34,B37,B38,B39,B40,B44,B45,B46,B48,B49,B51,B52,B53,B54,B55,B59,B61,B64,B65,B69,B7,B71,B76,B79,B8,B82,B83,B86,B90,B92,B93,B94,B95,B97,C12,C16,C17,C20,C21,C24,C29,C31,C33,C36,C37,C38,C4,C42,C43,C44,C45,C47,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C60,C61,C62,C70,C72,C73,C75,C76,C77,C79,C8,C80,C84,C87,C9,D1,D2,D3,D5,D7,D8,D9
`Chr7:28244634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:28244672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	55	A11,A15,A2,A24,A3,A7,A9,B102,B105,B109,B112,B114,B123,B19,B2,B22,B35,B36,B41,B44,B50,B57,B60,B68,B70,B75,B79,B8,B80,B89,B91,B98,C1,C10,C13,C22,C28,C3,C32,C34,C35,C40,C44,C48,C6,C62,C68,C7,C72,C74,C76,C77,C81,C86,D8
`Chr7:28244853`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777268.1

128 aa

128

Ribosomal_L32p

PF01783 Ribosomal_L32p 73-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777268.1`	Pfam	`PF01783`	Ribosomal_L32p	Family	73	118	1.9e-11	44.7	Ribosomal L32p protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921285.1
AGTTAGAAGAGAATACGACACCGTTTACATCGTTCCTATCTCACTCTATTCCTCCCACATACCATTCGCTCAAAGCCCTATTTCGGTATTTCCTAAACCCTCCTAATATCTCATCTCCTTTCTATTTCACAAAGCAAACCATTTACAGTCCGTCTCGATGTTAAGATGCGCCGGCAGAAAAGCGGACTCAGCCGTCGGAGGCTTCCGGCTGCTGGTGCACTCATTGGCCCAAGCTGCGCCGTTGGCGACCGCTATCAACC...

XM_057921284.1
GTTAGAAGAGAATACGACACCGTTTACATCGTTCCTATCTCACTCTATTCCTCCCACATACCATTCGCTCAAAGCCCTATTTCGGTATTTCCTAAACCCTCCTAATATCTCATCTCCTTTCTATTTCACAAAGCAAACCATTTACAGTCCGTCTCGATGTTAAGATGCGCCGGCAGAAAAGCGGACTCAGCCGTCGGAGGCTTCCGGCTGCTGGTGCACTCATTGGCCCAAGCTGCGCCGTTGGCGACCGCTATCAACCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995831
ATGTTAAGATGCGCCGGCAGAAAAGCGGACTCAGCCGTCGGAGGCTTCCGGCTGCTGGTGCACTCATTGGCCCAAGCTGCGCCGTTGGCGACCGCTATCAACCACCATTTCAGTACCACATTGCCGCCGTTTGTTTTGCCGGAAAATCATGACGACAATAATATGGGCTCTCGTTTTCTCGATTCTCCTTTCTTCGGCGGGGCTATGGAATTGATGGCAGTCCCCAAGAGGAAGATTTCTCCACACAGGAGGGGTATTAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777267.1
MLRCAGRKADSAVGGFRLLVHSLAQAAPLATAINHHFSTTLPPFVLPENHDDNNMGSRFLDSPFFGGAMELMAVPKRKISPHRRGIRNGPKALKPVPVIIKCNARFAQNSPFDLLLQSHQGGAPARGGSQLCLEHQLWMLLR

XP_057777268.1
MLRCAGRKADSAVGGFRLLVHSLAQAAPLATAINHHFSTTLPPFVLPENHDDNNMGSRFLDSPFFGGAMELMAVPKRKISPHRRGIRNGPKALKPVPVIIKCKVCGRVKLPHFFCCGGIKPNPEQNNN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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