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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002826`

染色体: Chr07 坐标: 28319851-28324362 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002826`
名称	SmilChr07G002826
描述	rhamnogalacturonan I rhamnosyltransferase 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	28319851 - 28324362 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995800`
GeneID	`130995800`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995800`
原始查询	`SmilChr07G002826`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rhamnogalacturonan I rhamnosyltransferase 1
产物	rhamnogalacturonan I rhamnosyltransferase 1
Arabidopsis	`AT1G14020` (AT1G14020) O-fucosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837963] identity=74.9; qcov=0.96; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0169000` (OSJNBa0091P11.24) - identity=64.6; qcov=0.936; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	-
Pfam	PF10250 (O-FucT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995800

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057777212.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057777212.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777212.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777212.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777212.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:28320215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,D10
`Chr7:28320367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr7:28320403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,D10
`Chr7:28321184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:28322129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr7:28323569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C2
`Chr7:28323698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr7:28323699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777212.1

498 aa

249

498

O-FucT

PF10250 O-FucT 92-410 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777212.1`	Pfam	`PF10250`	O-FucT	Family	92	410	1.8e-109	367.3	GDP-fucose protein O-fucosyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921229.1
ATTCCCAATCTTTTTAAACAATTGAAAATTTATAAAATTCAACTCCAACTCTCTCTCTAAAAGTGGTGTATCATCATTAGGCCACCAAACAAAGAACTTTCAATCTGCAGAGCCCAACAAGAAATCGACTGATGAAAGTGAAGAAGAAAAAGAGGCAGAAAATACAAGAGAAAGATTAAATATAACCGTTACGCTGGCGATACCGTTACCGAGATGAAGGTTTGGCGACGGTAATGAGGCTTCAATGGAGGCGGGTAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995800
ATGGAGGCGGGTAGATCAGAGAGAAGTGCGGAGAAATCGCCGGCATTGCAGGGGCCGGTGATGCAGAGGACAAGGCTGCAGGTGTGGTTTATTAGGGTTTGTTCTAGTATTCTAATTTGGACGTGCTTGGTTCAACTCGTGGCGGTTGGGGAGCTCTGGCACCCTCGTTTGCTTACTGGAAATCCGGGCTCCACCAAAATGTCGGCCCATCAGGAGCGATCGTTGCCTACTCCGCCTCAGCTGCCAGCCAGGAATTACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777212.1
MEAGRSERSAEKSPALQGPVMQRTRLQVWFIRVCSSILIWTCLVQLVAVGELWHPRLLTGNPGSTKMSAHQERSLPTPPQLPARNYTSNGFLKISCNGGLNQMRSAICDMVTIARLLNLTLVVPELDKTSFWADPSNFEDIFDVEHFINSLRDEVRIVKRLPKRFGLRYGYQPLVKAPVSWSNEQYYLQQILPLFAKNKVLHFNRTDSRLANNGMSLELQKLRCRVNFQALKFTPQIEALGNKLVHIIQQKGPYLALHLR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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