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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002831`

染色体: Chr07 坐标: 28351036-28355124 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002831`
名称	SmilChr07G002831
描述	protein RETARDED ROOT GROWTH, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	28351036 - 28355124 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995805`
GeneID	`130995805`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995805`
原始查询	`SmilChr07G002831`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RETARDED ROOT GROWTH, mitochondrial
产物	protein RETARDED ROOT GROWTH%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT1G69380` (RRG) sporulation protein (DUF155) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843270] identity=62.47; qcov=1.0; evalue=4.34e-163; confidence=high
Rice	`Os07g0694800` - identity=61.24; qcov=0.817; evalue=2.12e-135; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02582 (DUF155)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995805

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057777217.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.40000	`XP_057777217.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:28351180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr7:28351181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr7:28352889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr7:28353396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:28354661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777217.1

372 aa

186

372

DUF155

PF02582 DUF155 150-320 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777217.1`	Pfam	`PF02582`	DUF155	Domain	150	320	2.6e-31	109.8	RMND1/Sif2-Sif3/Mrx10, DUF155

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921234.1
CACAAGAGCATAATTTATCAGGAAGCAATTAATAAAACAGGTGACGGTGAATTGGCTAGGGCTTTTGACCTAAATCCCATTTGAAAATTAGTTGTCTTGAAAATCCTTCAACAGCAACTACAAATATTGACCACAGCAACAGATTTCGCCCTCCTTTTGAGCACCATGCAGAGAATGGAGTGAATTCGAGAAAAAATAAAGGGACAAGAAATTAAACAGCGAGCAAGAATTTTGCCACTGTTTAGCCCAGTGAATGGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057777217.1_38164
ATGGGGAGATGGAGACTTTCTGTCGCAGTTTCCCGCATCGTATCAGCTTCCAAATCCATTAATAACCCAAACTTGAGCAGGAACCCACGTATTAGATCCCAAATTTCTTCTTTAATTTCAGGGCCCAGGAATCATTTCTCGAGTTTCAGGCCCTTCTCTGCTCTCCCAGCATCTCCACGCTACGTCGAAGAATTTGATGCCAGTAATCACGATTTTGATGCAAATCAGATTTTGGAGGAATTGTTGGAAGATGAAGAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777217.1
MGRWRLSVAVSRIVSASKSINNPNLSRNPRIRSQISSLISGPRNHFSSFRPFSALPASPRYVEEFDASNHDFDANQILEELLEDEEAGKISVRAFFLCTSVDLKSMQAENSKHIIPPTSRSSNSIALRFCGPPWQTQGATGDGMRCYHYMIVYQYGSAILFNVEDHEVDFYLQAVRRHASGLLTEMRKDDYAIKEKPLLVEDMQGGPDHIVLKNLDMDSIRIIGSVLGQSIALDYFVSQVDGMVEEFAQINRAMQKTGTF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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