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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002835`

染色体: Chr07 坐标: 28393475-28394035 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002835`
名称	SmilChr07G002835
描述	uncharacterized SmilChr07G002835
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	28393475 - 28394035 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994035`
GeneID	`130994035`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994035`
原始查询	`SmilChr07G002835`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=38.9; qcov=0.387; evalue=1.44e-10; confidence=low
Rice	`Os12g0292200` - identity=44.2; qcov=0.511; evalue=1.49e-21; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994035

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775057.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057775057.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057775057.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775057.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775057.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:28393487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B1
`Chr7:28393487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:28393517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	133	A1,A11,A14,A18,A20,A21,A24,A25,A4,A5,A6,A7,A8,B101,B103,B105,B107,B109,B111,B113,B115,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B130,B132,B134,B135,B136,B139,B14,B15,B18,B19,B20,B21,B24,B25,B27,B32,B34,B36,B37,B38,B39,B40,B42,B43,B44,B45,B48,B49,B51,B52,B54,B55,B59,B60,B61,B62,B64,B69,B7,B71,B75,B76,B79,B8,B82,B84,B86,B87,B89,B9,B93,B94,B95,B99,C12,C14,C16,C17,C20,C22,C24,C26,C29,C31,C33,C36,C37,C38,C42,C43,C45,C47,C49,C5,C50,C53,C54,C55,C58,C60,C61,C62,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C79,C8,C80,C84,C85,C9,D1,D2,D3,D5,D7,D8,D9
`Chr7:28393519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr7:28393612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,C44,C48,C82
`Chr7:28393615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr7:28393673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B140,B78,C48
`Chr7:28393691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B10,B117,B140,B78,C23,C44,C48,C82
`Chr7:28393696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C50
`Chr7:28393696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr7:28393706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,C50
`Chr7:28393729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775057.1

186 aa

186

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 89-180 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775057.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	89	180	2.8e-05	25.4	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919074.1
ATGCCATTCACTCAGCGCTATCAGAAAGAGAGGGTGAAAGAGCAGTTCTCCAAGTTCATAGAGATCTTCAAGAAGGTGCATATTAACATTCCATTGGTGGAAGCACTGCAGGAGATGCCGCAGTATGCTAAATTCCTGAAGGATATTATCAAGAGGAAGAAGAGGCTGCGAGAGTTTAAGACGGTAAATCTCAATGAGGAATGCAGCGCAATCTTGCAGTGGAAGCTCCCAGCAAAGCTCAAACATCCAGGTAGCTTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994035
ATGCCATTCACTCAGCGCTATCAGAAAGAGAGGGTGAAAGAGCAGTTCTCCAAGTTCATAGAGATCTTCAAGAAGGTGCATATTAACATTCCATTGGTGGAAGCACTGCAGGAGATGCCGCAGTATGCTAAATTCCTGAAGGATATTATCAAGAGGAAGAAGAGGCTGCGAGAGTTTAAGACGGTAAATCTCAATGAGGAATGCAGCGCAATCTTGCAGTGGAAGCTCCCAGCAAAGCTCAAACATCCAGGTAGCTTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775057.1
MPFTQRYQKERVKEQFSKFIEIFKKVHINIPLVEALQEMPQYAKFLKDIIKRKKRLREFKTVNLNEECSAILQWKLPAKLKHPGSFTISCTIGGQQFGKALCDLGASINLMPLSIFQRLAIGEMKPTSIALQMADRSVTYPRGIVEDVLVKVNEFIFSADFVMLDFEEDKTIPLILGRPFWPREEL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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