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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002846`

染色体: Chr07 坐标: 28580549-28584954 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002846`
名称	SmilChr07G002846
描述	probable protein S-acyltransferase 22
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	28580549 - 28584954 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995857`
GeneID	`130995857`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995857`
原始查询	`SmilChr07G002846`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable protein S-acyltransferase 22
产物	probable protein S-acyltransferase 22
Arabidopsis	`AT1G69420` (AT1G69420) DHHC-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843274] identity=62.4; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0209500` - identity=54.1; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0006612 (protein targeting to membrane); GO:0018230 (peptidyl-L-cysteine S-palmitoylation); GO:0019706 (protein-cysteine S-palmitoyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01529 (DHHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995857

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057777287.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057777287.1`
3	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057777287.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777287.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777287.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:28582288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr7:28582353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B129,B86,C17
`Chr7:28582363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B132,C2
`Chr7:28582392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr7:28582428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr7:28583581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,D3
`Chr7:28583956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C27
`Chr7:28584224`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A18
`Chr7:28584224`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A18
`Chr7:28584376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B34,C38
`Chr7:28584400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C2
`Chr7:28584427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777287.1

622 aa

311

622

DHHC

PF01529 DHHC 176-309 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777287.1`	Pfam	`PF01529`	DHHC	Family	176	309	1.6e-29	103.3	DHHC palmitoyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921304.1
TTTATAAATGTTATATCTACTGCTGCACTCGCAGTAAAAAAACTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGAATTGAATGGGTTGTTATGAGCAGAGAAAAGAGAAAACACAGGGATTGAATGGGTTGTTAAGAGCAGAGAAAAGAGAAAACACACAGTAGAAGTAGTATACAAGTGGGTGGTGTAGTGAAGAGGTGTGGACAAATGATGTTGAGATTGCTCATGGAGAAAAAGGCAATGCAAGAAACAAGGGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995857
ATGAGAAAGCATGGATGGCAGCTTCCTTACCACCCACTCCAGGTGGTAGCTGTTGCTGTATTTCTGGCATTGGGGTTTGCTTTCTATGTGTTCTTTGCCCCTTTTGTTGGGAGACAATTGTTTCAATACATTGCGATGGGGATTTACACTCCTCTTCTAGCATGCGCATTTGGTCTATACATTTGGTGTGCTGGTGCTGATCCTGCTGATGCCGGCGTCTTCAAATCAAAAAAATATCTTAAGGTCCTCGATAACAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777287.1
MRKHGWQLPYHPLQVVAVAVFLALGFAFYVFFAPFVGRQLFQYIAMGIYTPLLACAFGLYIWCAGADPADAGVFKSKKYLKVLDNKEHIKQNACKHGGESTSSVLDGNAAAIGGEANDKGRNDVESAAERNTEAEKDDSSPHKRACSVGLLALVPCAYFCISHEESSDHQSEDGMFYCSLCEVEVFKYSKHCRVCDKCVDRFDHHCRWLNNCIGKRNYRKFFTLMVSALLLLIIQWSTGILVLILCFLKRKQFATDISSK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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