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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002847`

染色体: Chr07 坐标: 28585103-28586077 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002847`
名称	SmilChr07G002847
描述	uncharacterized SmilChr07G002847
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	28585103 - 28586077 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994040`
GeneID	`130994040`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994040`
原始查询	`SmilChr07G002847`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820354]; symbol=AT3G11810; hit=AT3G11810; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820354]; symbol=AT3G11810; hit=AT3G11810; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G11810` (AT3G11810) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820354] identity=35.6; qcov=1.03; evalue=5.34e-46; confidence=medium
Rice	`Os12g0257500` - identity=32.8; qcov=0.395; evalue=5.52e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29520 (DUF8558)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994040

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057775061.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057775061.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057775061.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057775061.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775061.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:28585313`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A16,B103,B137,B16,B26,B49,B56,B66,B69,B96,C28,C30,C41,C70,C73
`Chr7:28585316`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A16,B103,B137,B16,B26,B49,B56,B66,B69,B96,C28,C30,C41,C70,C73
`Chr7:28585380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr7:28585597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr7:28585598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C2
`Chr7:28585684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,D3
`Chr7:28585898`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B102
`Chr7:28585898`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B102
`Chr7:28585970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775061.1

324 aa

162

324

DUF8558

PF29520 DUF8558 84-298 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775061.1`	Pfam	`PF29520`	DUF8558	Domain	84	298	7.8e-13	49.1	Domain of unknown function (DUF8558)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919078.1
ATGGCGCCCGACCGGCCAAACCTATGGCGAATACTTTCCGACAGCTCCGGCATAATCAGCGCCCACTCCCTTCATTTCTCGGCACTCTCAATCCTCTTCATCTTCCCCTCATCCTTGGCCAGCGCCGTCTACACCCTGCTCTCCCTCCCCAATAACCCACTCCAAACCCTCTACCTCCGACTCTTATCCATCTTCTCCGCCGCGGACTACCAAATTCCCGCCGTCGGAGCATCCCAGCTCCTCTTCCCCCTCATCTCGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994040
ATGGCGCCCGACCGGCCAAACCTATGGCGAATACTTTCCGACAGCTCCGGCATAATCAGCGCCCACTCCCTTCATTTCTCGGCACTCTCAATCCTCTTCATCTTCCCCTCATCCTTGGCCAGCGCCGTCTACACCCTGCTCTCCCTCCCCAATAACCCACTCCAAACCCTCTACCTCCGACTCTTATCCATCTTCTCCGCCGCGGACTACCAAATTCCCGCCGTCGGAGCATCCCAGCTCCTCTTCCCCCTCATCTCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775061.1
MAPDRPNLWRILSDSSGIISAHSLHFSALSILFIFPSSLASAVYTLLSLPNNPLQTLYLRLLSIFSAADYQIPAVGASQLLFPLISLFFTTFAAASISATTFNAFYGRPVELIAALKSALVSFLPLLATTLAVEIVIGVIVFAFLGLIILTSNGIASIGFDIDYYYENQYFLAIYMAIGVLLAALLIYLQIEWSLSNAVVVVESDWGLAALKRSSYLVKGARGIMFSFLLFFSILAGVLGIFYFKYVLIAYGNGSGDGWN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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