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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002853`

染色体: Chr07 坐标: 28678854-28679225 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002853`
名称	SmilChr07G002853
描述	uncharacterized SmilChr07G002853
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	28678854 - 28679225 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994043`
GeneID	`130994043`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994043`
原始查询	`SmilChr07G002853`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=36.7; qcov=0.976; evalue=1.28e-18; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994043

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057775064.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057775064.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057775064.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057775064.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775064.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:28678905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B88,C56,C59
`Chr7:28678912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C61
`Chr7:28678931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr7:28678953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C70
`Chr7:28678976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A3,B129,B4,B80,C15,C56,C82
`Chr7:28678985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,C11
`Chr7:28678995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B37,B71
`Chr7:28679010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,B89,C4
`Chr7:28679011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr7:28679012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B140,B24,B53,C19
`Chr7:28679033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B1,B81,C25
`Chr7:28679033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B81,C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775064.1

123 aa

123

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 2-67 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775064.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	2	67	2.6e-10	41.2	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919081.1
ATGGAGGAATGGATAAGAGAGCTGGAAAGAATCTTTGAACATATCGAGTGCACTGATGCCCACAAAGTTTCATGTGCTGTCTTTCAATTCTGCGAGGATGCTAGCCATTGGTGGGAGTCCTTCAAGCGATCAATGACCGAACAAGCGCGACAAGGGTTGACATGGAATAGGTTCAAGGAGATTGTGACCAACCAATACTTTCCACGCTCCTACCGCAATCAAAAGGAGGCCGAATTCTTGGATCTCAAACAAGGAGAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994043
ATGGAGGAATGGATAAGAGAGCTGGAAAGAATCTTTGAACATATCGAGTGCACTGATGCCCACAAAGTTTCATGTGCTGTCTTTCAATTCTGCGAGGATGCTAGCCATTGGTGGGAGTCCTTCAAGCGATCAATGACCGAACAAGCGCGACAAGGGTTGACATGGAATAGGTTCAAGGAGATTGTGACCAACCAATACTTTCCACGCTCCTACCGCAATCAAAAGGAGGCCGAATTCTTGGATCTCAAACAAGGAGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775064.1
MEEWIRELERIFEHIECTDAHKVSCAVFQFCEDASHWWESFKRSMTEQARQGLTWNRFKEIVTNQYFPRSYRNQKEAEFLDLKQGELSITDYEMKFNQLSRYATRLVNTNDQKTDRFLRGLRP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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