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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002859`

染色体: Chr07 坐标: 28751815-28752816 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002859`
名称	SmilChr07G002859
描述	uncharacterized SmilChr07G002859
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	28751815 - 28752816 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994045`
GeneID	`130994045`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994045`
原始查询	`SmilChr07G002859`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=31.1; qcov=1.01; evalue=1.24e-29; confidence=low
Rice	`Os01g0930300` - identity=24.3; qcov=0.913; evalue=1.42e-14; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994045

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775065.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057775065.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057775065.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775065.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775065.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:28751844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,C17,C45,C61
`Chr7:28751916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A11,A16,A21,B125,B14,B88,B9,B90,B93,B98,C13,C25,C3,C37,C46,C48,D6,D8,D9
`Chr7:28751922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,D10
`Chr7:28751930`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B41,B9
`Chr7:28751930`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B41,B9
`Chr7:28751990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,D10
`Chr7:28751991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,C17,C45,C61
`Chr7:28751996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr7:28751999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:28752003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr7:28752013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B91,C57
`Chr7:28752020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775065.1

333 aa

166

333

zf-RVT

RVT_3

PF13966 zf-RVT 2-95 aa PF13456 RVT_3 199-311 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775065.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	2	95	1.7e-16	61.3	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057775065.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	199	311	4.4e-17	62.9	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919082.1
ATGTATTCGGTTAAAAGTGGTTATCAGCTGGCTCTGAATTTAAGGTTGAGGTCTGAGGCGACTTCGTCTGCTCAGTATGCTGGTTTATGGAAATGGATATGGGGGCTGGATGTTATACCTAAGGTCAGGTTATTCATGTGGAAATGTTTAGCCAATGCTCTTCCTACGAATCAAGCGCTCAGAAGCCGGTGCATTGATGTTGAAGCTCTCTGTAGAAGATGTGGTGAACATGAGGAGACTATGGAACACGCGCTTCGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994045
ATGTATTCGGTTAAAAGTGGTTATCAGCTGGCTCTGAATTTAAGGTTGAGGTCTGAGGCGACTTCGTCTGCTCAGTATGCTGGTTTATGGAAATGGATATGGGGGCTGGATGTTATACCTAAGGTCAGGTTATTCATGTGGAAATGTTTAGCCAATGCTCTTCCTACGAATCAAGCGCTCAGAAGCCGGTGCATTGATGTTGAAGCTCTCTGTAGAAGATGTGGTGAACATGAGGAGACTATGGAACACGCGCTTCGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775065.1
MYSVKSGYQLALNLRLRSEATSSAQYAGLWKWIWGLDVIPKVRLFMWKCLANALPTNQALRSRCIDVEALCRRCGEHEETMEHALRDCAWVEALWSVSSLRLKPISGICSIPAWFEMIRNCPHRESHSQFAMLAWTIWYARNLLVFQQKDLNHVDCLATATRAQWVVPVVASSHQHQELKVSCTRVGQMKISTDAVLDEGVGIGVGVVMKDGDNGVVRCRLGFKAGIYSVVEAEALAMLESFYLCREHGITDAIFETDCQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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