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同源 qcov 为最佳单个 HSP 在查询序列上的坐标跨度／序列长度；置信度是规则分级，不是已验证的正交关系。

Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr07G002868

染色体: Chr07 坐标: 28890182-28893465 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 IDSmilChr07G002868
名称SmilChr07G002868
描述clp protease adapter protein ClpF, chloroplastic
染色体 / SeqIDChr07 / NC_080393.1
坐标与链方向28890182 - 28893465 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130995873
GeneID130995873
locus_tag-
NCBI 名称LOC130995873
原始查询SmilChr07G002868

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述clp protease adapter protein ClpF, chloroplastic
产物clp protease adapter protein ClpF%2C chloroplastic
拟南芥AT2G03390 (AT2G03390)
uvrB/uvrC motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814868]
identity=61.3; qcov=0.941; evalue=8.56e-140; confidence=high
水稻Os08g0172200 (OJ1590_E05.35-1)
-
identity=64.37; qcov=0.77; evalue=3.82e-121; confidence=high
GOGO:0003677 (DNA binding); GO:0005515 (protein binding)
KEGG-
PfamPF02151 (UVR); PF08755 (YccV-like)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130995873

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序定位位置预测得分蛋白 ID
1 叶绿体 1.00000 XP_057777326.1
2 叶绿体基质 1.00000 XP_057777326.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 参考等位基因 变异等位基因 类型 影响 携带材料数 材料
Chr7:28890418 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 C44,C71
Chr7:28890428 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B72,C65,D3,D6
Chr7:28890454 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B42,B43
Chr7:28890898 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B108,B119,B122,B81
Chr7:28891174 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 A6,B61
Chr7:28891179 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B128,B71,C17,C45,C61
Chr7:28891224 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D11
Chr7:28891606 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B72,C65,D3,D6
Chr7:28891613 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B72,C65,D3,D6
Chr7:28891717 G A EMS_canonical_SNV stop_gained 1 C3
Chr7:28891717 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C3
Chr7:28892357 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B131,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777326.1
341 aa
N
1
170
341
UVR
YccV-like
C
PF02151 UVR 160-191 aa PF08755 YccV-like 209-308 aa
XP_057777327.1
341 aa
N
1
170
341
UVR
YccV-like
C
PF02151 UVR 160-191 aa PF08755 YccV-like 209-308 aa
XP_057777328.1
341 aa
N
1
170
341
UVR
YccV-like
C
PF02151 UVR 160-191 aa PF08755 YccV-like 209-308 aa
XP_057777330.1
341 aa
N
1
170
341
UVR
YccV-like
C
PF02151 UVR 160-191 aa PF08755 YccV-like 209-308 aa
XP_057777331.1
341 aa
N
1
170
341
UVR
YccV-like
C
PF02151 UVR 160-191 aa PF08755 YccV-like 209-308 aa
XP_057777332.1
339 aa
N
1
170
339
UVR
YccV-like
C
PF02151 UVR 160-191 aa PF08755 YccV-like 209-306 aa
XP_057777333.1
339 aa
N
1
170
339
UVR
YccV-like
C
PF02151 UVR 160-191 aa PF08755 YccV-like 209-306 aa
XP_057777334.1
339 aa
N
1
170
339
UVR
YccV-like
C
PF02151 UVR 160-191 aa PF08755 YccV-like 209-306 aa
XP_057777335.1
339 aa
N
1
170
339
UVR
YccV-like
C
PF02151 UVR 160-191 aa PF08755 YccV-like 209-306 aa
蛋白 ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value 得分 说明
XP_057777326.1 Pfam PF02151 UVR Family 160 191 4e-08 33.5 UvrB/uvrC motif
XP_057777326.1 Pfam PF08755 YccV-like Domain 209 308 8e-28 97.4 Hemimethylated DNA-binding protein YccV like
XP_057777327.1 Pfam PF02151 UVR Family 160 191 4e-08 33.5 UvrB/uvrC motif
XP_057777327.1 Pfam PF08755 YccV-like Domain 209 308 8e-28 97.4 Hemimethylated DNA-binding protein YccV like
XP_057777328.1 Pfam PF02151 UVR Family 160 191 4e-08 33.5 UvrB/uvrC motif
XP_057777328.1 Pfam PF08755 YccV-like Domain 209 308 8e-28 97.4 Hemimethylated DNA-binding protein YccV like
XP_057777330.1 Pfam PF02151 UVR Family 160 191 4e-08 33.5 UvrB/uvrC motif
XP_057777330.1 Pfam PF08755 YccV-like Domain 209 308 8e-28 97.4 Hemimethylated DNA-binding protein YccV like
XP_057777331.1 Pfam PF02151 UVR Family 160 191 4e-08 33.5 UvrB/uvrC motif
XP_057777331.1 Pfam PF08755 YccV-like Domain 209 308 8e-28 97.4 Hemimethylated DNA-binding protein YccV like
XP_057777332.1 Pfam PF02151 UVR Family 160 191 3.9e-08 33.5 UvrB/uvrC motif
XP_057777332.1 Pfam PF08755 YccV-like Domain 209 306 4.5e-28 98.2 Hemimethylated DNA-binding protein YccV like
XP_057777333.1 Pfam PF02151 UVR Family 160 191 3.9e-08 33.5 UvrB/uvrC motif
XP_057777333.1 Pfam PF08755 YccV-like Domain 209 306 4.5e-28 98.2 Hemimethylated DNA-binding protein YccV like
XP_057777334.1 Pfam PF02151 UVR Family 160 191 3.9e-08 33.5 UvrB/uvrC motif
XP_057777334.1 Pfam PF08755 YccV-like Domain 209 306 4.5e-28 98.2 Hemimethylated DNA-binding protein YccV like
XP_057777335.1 Pfam PF02151 UVR Family 160 191 3.9e-08 33.5 UvrB/uvrC motif
XP_057777335.1 Pfam PF08755 YccV-like Domain 209 306 4.5e-28 98.2 Hemimethylated DNA-binding protein YccV like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

9 records

下载 cDNA FASTA
XM_057921350.1
GCAGAGAGTAGTAATTATTTATGCTTTTCTATTTGAGATATTCTTTTTCTTTTCTTTTCCCGTTAATCAATGAAGGCCAGTAAACTGTGTGACTCAGGGAAAGAGCTGAGAGATACGAATCGCAGGGCAAACTACCGAAGAAAAAACACATTCTTCACACACTCGAGGTGCCAGTTCCAACGCTTGAAATAGGACCATAACGTTGTTTCCAGGAAAATAGGAAACGATGGTTTGATACATTGAGGAGCTGTGAGGCCTTG...
XM_057921349.1
TAATTATTTATGCTTTTCTATTTGAGATATTCTTTTTCTTTTCTTTTCCCGTTAATCAATGAAGGCCAGTAAACTGTGTGACTCAGGGAAAGAGCTGAGAGATACGAATCGCAGGGCAAACTACCGAAGAAAAAACACATTCTTCACACACTCGAGGTTGTTTCCAGGAAAATAGGAAACGATGGTTTGATACATTGAGGAGCTGTGAGGCCTTGCCTTTCTCCATTACTCAAAAGCAGTGAACACTTTGGGAGGGTTAT...

CDS

9 records

下载 CDS FASTA
lcl|NC_080393.1_cds_XP_057777332.1_38209
ATGGTGCAAAATTCGATAAACCCTTTGGTGACTTCTAGAAGCAGTGTTTTGTGTGGATCAAGTGATTGGTCAAGGAGAAGTGCCAGCCAAGTTAGGGAGGCGTATTTAGTTCTTGGGGCTCCAAGGTTGTGTCTCTGTGCTTACGGTGGGAGAGGGACTTCCTTTGCTGGACCATGTAAGGTGTCCCAACGTAGTGGTTTGAGGGTTCAAGCTGGATGGCTATTTAGAGGAAATGATAAGGGATCAGAATTGGATGCGAG...
lcl|NC_080393.1_cds_XP_057777333.1_38210
ATGGTGCAAAATTCGATAAACCCTTTGGTGACTTCTAGAAGCAGTGTTTTGTGTGGATCAAGTGATTGGTCAAGGAGAAGTGCCAGCCAAGTTAGGGAGGCGTATTTAGTTCTTGGGGCTCCAAGGTTGTGTCTCTGTGCTTACGGTGGGAGAGGGACTTCCTTTGCTGGACCATGTAAGGTGTCCCAACGTAGTGGTTTGAGGGTTCAAGCTGGATGGCTATTTAGAGGAAATGATAAGGGATCAGAATTGGATGCGAG...

Protein

9 records

下载 Protein FASTA
XP_057777326.1
MVQNSINPLVTSRSSVLCGSSDWSRRSASQVREAYLVLGAPRLCLCAYGGRGTSFAGPCKVSQRSGLRVQAGWLFRGNDKGSELDASCEHSERANEDILMFFFELDLATRVQYALNLEQYEVAQQLRNQLTEVESEVIKLRESRRGSSSKSEAQDMAISILRLRADLQNAVENENYNRAAELRDEISKLEANSLAASAKAQAYESAKYAFRLGQKVKHKVFGYRAVVCGMDPACCESKSWIDGANIDKLTRGPDQPFYQV...
XP_057777327.1
MVQNSINPLVTSRSSVLCGSSDWSRRSASQVREAYLVLGAPRLCLCAYGGRGTSFAGPCKVSQRSGLRVQAGWLFRGNDKGSELDASCEHSERANEDILMFFFELDLATRVQYALNLEQYEVAQQLRNQLTEVESEVIKLRESRRGSSSKSEAQDMAISILRLRADLQNAVENENYNRAAELRDEISKLEANSLAASAKAQAYESAKYAFRLGQKVKHKVFGYRAVVCGMDPACCESKSWIDGANIDKLTRGPDQPFYQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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