当前解析结果
SmilChr07G002870| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002870 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002870 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002870 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 28900240 - 28902366 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130995884 |
|---|---|
| GeneID | 130995884 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995884 |
| 原始查询 | SmilChr07G002870 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814871]; symbol=AT2G03420; hit=AT2G03420; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814871]; symbol=AT2G03420; hit=AT2G03420; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT2G03420 (AT2G03420)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814871] identity=69.05; qcov=0.656; evalue=1.17e-55; confidence=high |
| Rice | Os03g0210700- identity=61.91; qcov=0.219; evalue=4.87e-13; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995884 |
特征证据限制:抽查两个保留的历史缓存共 206 行,PROFEAT 特征全部为零;第二块缓存为 106 行,比对应 FASTA 的 100 个蛋白多 6 个。ESM2 特征在抽查范围内为有限非零值。缓存与当前定位结果的历史执行链仍未核实,不能据蛋白编号重合认定这些特征用于线上预测,也不能将抽查推广到全蛋白组。当前结果仅作为探索性候选,特征完整性与预测可靠性尚未建立。
| Rank | 定位位置 | 中文 | 五折投票比例 | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057777355.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 1.00000 | XP_057777355.1 |
| 3 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 0.40000 | XP_057777355.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:28900495 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B108,B119,B122,B81 |
Chr7:28901498 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B90,B92,C21,D10 |
Chr7:28901507 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 8 | A19,B125,B21,B32,B89,C49,C50,C72 |
Chr7:28901551 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 59 | A11,A13,A15,A20,A24,B102,B112,B118,B12,B124,B125,B126,B133,B135,B19,B20,B24,B33,B39,B40,B43,B45,B54,B58,B65,B69,B8,B83,B85,B87,B88,B92,B93,B94,B96,C11,C12,C23,C25,C26,C28,C31,C34,C58,C59,C62,C64,C65,C66,C69,C7,C77,C81,C84,D2,D3,D5,D6,D8 |
Chr7:28901670 |
GAA |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 12 | A2,A9,B140,B22,B44,B50,B89,C1,C44,C6,C62,D8 |
Chr7:28901675 |
T |
TCC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 12 | A2,A9,B140,B22,B44,B50,B89,C1,C44,C6,C62,D8 |
Chr7:28901678 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 211 | A1,A10,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A21,A22,A23,A25,A3,A4,A5,A6,A8,B1,B10,B100,B101,B102,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B113,B114,B115,B117,B12,B121,B122,B123,B124,B125,B127,B128,B129,B131,B132,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B14,B140,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B44,B45,B47,B48,B49,B5,B51,B52,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B79,B8,B81,B82,B83,B84,B86,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B97,B99,C11,C12,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C40,C42,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C60,C61,C62,C63,C64,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D9 |
Chr7:28901866 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 88 | A1,A18,A21,A5,A7,A8,B101,B103,B104,B108,B109,B11,B110,B111,B113,B114,B117,B120,B127,B128,B129,B131,B132,B134,B138,B139,B140,B17,B18,B23,B27,B3,B30,B31,B35,B4,B41,B48,B49,B5,B55,B57,B59,B6,B62,B7,B70,B73,B75,B78,B79,B84,B85,B91,B95,C10,C13,C16,C17,C18,C19,C20,C24,C27,C29,C3,C30,C33,C35,C36,C37,C42,C46,C5,C51,C52,C53,C54,C56,C57,C61,C70,C71,C75,D11,D4,D7,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。