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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002877`

染色体: Chr07 坐标: 28977788-28981406 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002877`
名称	SmilChr07G002877
描述	protein root UVB sensitive 3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	28977788 - 28981406 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995889`
GeneID	`130995889`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995889`
原始查询	`SmilChr07G002877`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein root UVB sensitive 3-like
产物	protein root UVB sensitive 3-like
Arabidopsis	`AT1G13770` (RUS3) root UVB sensitive protein (Protein of unknown function, DUF647) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837937] identity=67.5; qcov=0.952; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0290800` (OsRUS1) - identity=32.1; qcov=0.769; evalue=1.48e-43; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04884 (UVB_sens_prot); PF24160 (UVB_sens_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995889

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057777365.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057777365.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057777365.1`
4	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057777365.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777365.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:28978157`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B121
`Chr7:28978157`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B121
`Chr7:28978530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B41,D9
`Chr7:28979071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:28979324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr7:28979532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C60
`Chr7:28979724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,B72,B95
`Chr7:28980063`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B101,B18
`Chr7:28980063`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B101,B18
`Chr7:28980389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B72
`Chr7:28980667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr7:28980671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B34,C38,C71,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777365.1

442 aa

221

442

UVB_sens_prot

UVB_sens_C

PF04884 UVB_sens_prot 48-286 aa PF24160 UVB_sens_C 289-433 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777365.1`	Pfam	`PF04884`	UVB_sens_prot	Domain	48	286	3.4e-89	299.3	Vitamin B6 photo-protection and homoeostasis domain
`XP_057777365.1`	Pfam	`PF24160`	UVB_sens_C	Domain	289	433	3.3e-13	51.0	Root UVB sensitive protein, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921382.1
TATTTTTGGCATAAATATTAGCAGCACGTCGACAGGGAGAGAAGCAGCAATGGAAGGAGGAGGCAGTTCAACGAGGCCGGAGACCTCGGTGATCGAAGAATGGAACGGCAGCGTTTCTTCAAAACTCACCAAGACTGCAGCCTTCACTGTCGCCGGACCCACCGTACGGAAATCGACTCTCCGTTTCAATCATTTTTCTCGGAGACTCCTCGACGCCTTTGTTCCTGAGGGGTTTCCGGGCAGCGTCACTCCTGATTATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995889
ATGGAAGGAGGAGGCAGTTCAACGAGGCCGGAGACCTCGGTGATCGAAGAATGGAACGGCAGCGTTTCTTCAAAACTCACCAAGACTGCAGCCTTCACTGTCGCCGGACCCACCGTACGGAAATCGACTCTCCGTTTCAATCATTTTTCTCGGAGACTCCTCGACGCCTTTGTTCCTGAGGGGTTTCCGGGCAGCGTCACTCCTGATTATGTCCCTTTTCAAATATGGGATTCATTGCAGGGCCTTTCGACTTATGTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777365.1
MEGGGSSTRPETSVIEEWNGSVSSKLTKTAAFTVAGPTVRKSTLRFNHFSRRLLDAFVPEGFPGSVTPDYVPFQIWDSLQGLSTYVRTMLSTQALLSAIGVGEKSATVIGATFQWFLRDLTGMLGGVLFTFYQVTFPGADLDSNAKMWRLVADLMNDAGMLMDLLSPLFPSAFLVIVCLGSISRSFTGVASGATRAALTQHFALQNNAADISAKEGSQETLATMVGMALGMLLAHITMGHSMAIWFCFLSLTIFHMYANY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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