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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002890`

染色体: Chr07 坐标: 29214952-29218975 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002890`
名称	SmilChr07G002890
描述	protein SUPPRESSOR OF GENE SILENCING 3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	29214952 - 29218975 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995860`
GeneID	`130995860`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995860`
原始查询	`SmilChr07G002890`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SUPPRESSOR OF GENE SILENCING 3-like
产物	protein SUPPRESSOR OF GENE SILENCING 3-like
Arabidopsis	`AT5G23570` (SGS3) XS domain-containing protein / XS zinc finger domain-containing protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832422] identity=46.3; qcov=1.04; evalue=2.37e-178; confidence=high
Rice	`Os12g0197500` (OsSGS3) - identity=56; qcov=0.705; evalue=2.99e-163; confidence=high
GO	GO:0031047 (regulatory ncRNA-mediated gene silencing); GO:0051607 (defense response to virus)
KEGG	-
Pfam	PF03468 (XS); PF03470 (zf-XS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995860

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057777292.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057777292.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057777292.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057777292.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777292.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:29215307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777292.1

606 aa

303

606

zf-XS

PF03470 zf-XS 212-250 aa PF03468 XS 282-397 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777292.1`	Pfam	`PF03470`	zf-XS	Domain	212	250	6.4e-08	33.5	XS zinc finger domain
`XP_057777292.1`	Pfam	`PF03468`	XS	Domain	282	397	1.6e-32	112.9	XS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921309.1
TTTGGAGTCCGGGGTAGAAATAGAAGCATAAATACAGTGTCAGTCTGCAACTGCAAGGAAAGAGAGAGAGGGAGTCTCCTTTTAGCTTGTCGAACACGCCCTTGCTTTCCCTTTCGTTCTCGTTTTCCCTCACGCTGATTTCGCCCGATCGTCTGCGCTAGAGATGAACTCGAGGAAAGGGATTGGGAATCCTTCTGGTGCAGTTACTTCTGATCCGTCAGTCAAAGGCGAAAGCAAAGCAGATGTATCTAACTCTAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995860
ATGAACTCGAGGAAAGGGATTGGGAATCCTTCTGGTGCAGTTACTTCTGATCCGTCAGTCAAAGGCGAAAGCAAAGCAGATGTATCTAACTCTAGCATTGATCAATTATCCCGGGGTGTTTCGGATATGAATATAAACCCTACAAACGATGATGGATGGGAAGAGTACGGAAAAAAATCAAAGAACAAAAACAAGAATAATGCTTCAAGACAGTTGGTTCCCCAGCATTCCACCCCTAAGGCATGGGGTCATGCTGACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777292.1
MNSRKGIGNPSGAVTSDPSVKGESKADVSNSSIDQLSRGVSDMNINPTNDDGWEEYGKKSKNKNKNNASRQLVPQHSTPKAWGHADTVQKLGFRTNGGLGQGSGRGYTRQQPSGRNPNSDYDAAPPVWNTRAASFQPSAQAADNQAFDEVDDDDESDGIDDSDDDLSDGFASDESHKSHETKKKNKWFKELFQCLDNLTVKEINEPERQWHCPACQGGPGAIDWYRGLQPLITHAKTKRSKRMKLHRELAEILDEELKRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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