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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002899`

染色体: Chr07 坐标: 29381575-29382754 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002899`
名称	SmilChr07G002899
描述	uncharacterized SmilChr07G002899
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	29381575 - 29382754 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995880`
GeneID	`130995880`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995880`
原始查询	`SmilChr07G002899`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995880

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777346.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057777346.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777346.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777346.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057777346.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:29381849`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A1,A3,B109,B114,B122,B123,B132,B137,B19,B3,B6,B61,B69,B73,C41,C55,C67,C77,C82
`Chr7:29381906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B72,B88,C65,C71
`Chr7:29381910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B72,B88,C65,C71
`Chr7:29381929`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B140,B15,B30,B35,B38,B39,B45,B60,C39,C82
`Chr7:29381941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr7:29381976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr7:29382106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr7:29382162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B72,B88,C65,C71
`Chr7:29382164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B67
`Chr7:29382164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr7:29382288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A1,A3,B109,B114,B122,B123,B132,B137,B19,B3,B6,B61,B69,B73,C41,C55,C67,C77,C82
`Chr7:29382299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B72,B88,C65,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777346.1

240 aa

120

240

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 18-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777346.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	18	112	5.7e-10	40.7	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921363.1
GAAATAGGGTTTTACTTCAAAGAACTCTCCCACTCTTGCGCCAACATGAAGCGAACTGACATTCCCAAACAACATGTCTTCTTCTATGACGCAATCTGGAAACAGGAGATGGACAAGATGTTACTCAACAAAATTCTCATGATAGAGCAGGAGACCGGGATTAAAGCTGGGGCTGGAGTTCATAGTCCAACGGTAATACGACATGCAATGGAGGACATTAACAGGGTGTTTAACAAATCAATCGGTTTCGTCGACATCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995880
ATGAAGCGAACTGACATTCCCAAACAACATGTCTTCTTCTATGACGCAATCTGGAAACAGGAGATGGACAAGATGTTACTCAACAAAATTCTCATGATAGAGCAGGAGACCGGGATTAAAGCTGGGGCTGGAGTTCATAGTCCAACGGTAATACGACATGCAATGGAGGACATTAACAGGGTGTTTAACAAATCAATCGGTTTCGTCGACATCAAAAATAGGCTGGTGGCGCTAGAGGGACGTTATGATACCTTCCAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777346.1
MKRTDIPKQHVFFYDAIWKQEMDKMLLNKILMIEQETGIKAGAGVHSPTVIRHAMEDINRVFNKSIGFVDIKNRLVALEGRYDTFQKIMQMSETRWDRELNRIFATDVVWDKIFSENVWAQAYYYSGEPEYNKMCALFGPKHIKMEPTHEVIEIGSTMNTIVISDDDEVSSPVVNVKGKVTRKLCYDDSESSSVPQKRSTGIAPNNLFPPRNSFHSKQYAEVSAPEPNEASSCASCSPFK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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