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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002925`

染色体: Chr07 坐标: 29625025-29627334 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002925`
名称	SmilChr07G002925
描述	folate synthesis bifunctional protein, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	29625025 - 29627334 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995945`
GeneID	`130995945`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995945`
原始查询	`SmilChr07G002925`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	folate synthesis bifunctional protein, mitochondrial
产物	folate synthesis bifunctional protein%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT4G30000` (AT4G30000) Dihydropterin pyrophosphokinase / Dihydropteroate synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829123] identity=69.6; qcov=0.935; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0618500` (B1056G08.147-1) - identity=61.4; qcov=0.982; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003848 (2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine diphosphokinase activity); GO:0004156 (dihydropteroate synthase activity); GO:0046654 (tetrahydrofolate biosynthetic process)
KEGG	smil00790 (Folate biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00809 (Pterin_bind); PF01288 (HPPK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995945

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057777448.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057777448.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777448.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777448.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777448.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:29626104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr7:29626153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:29626264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:29626335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:29626693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr7:29626715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777448.1

506 aa

253

506

HPPK

Pterin_bind

PF01288 HPPK 44-169 aa PF00809 Pterin_bind 230-485 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777448.1`	Pfam	`PF01288`	HPPK	Domain	44	169	3.3e-36	124.9	7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase (HPPK)
`XP_057777448.1`	Pfam	`PF00809`	Pterin_bind	Domain	230	485	2.7e-81	273.5	Pterin binding enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921465.1
TTTCAAGATTGCTGTTTTATACATTGTTAAAATCGTACTTCAACTTCGTAAACCAGAGATTCCAAATCTTTAGGGAGTTAAAATTATTTGCACAATTTCAGGTAGATTAGCTAAATTAATGGAAAATACAACATTGGGACCTCGCTGAATAGAGCATTTCTTGGGATGAATATTATCAAACAGGTGGTGGCCGTCAAATACGGTGGGAGAGCTGCTAAGACTTCATTTGAAGCAGCAAGATTGCGCCTATTTCATGATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995945
ATGAATATTATCAAACAGGTGGTGGCCGTCAAATACGGTGGGAGAGCTGCTAAGACTTCATTTGAAGCAGCAAGATTGCGCCTATTTCATGATGCTCCGGTGGAAGTGAACTCCGAGGAGCAGGAAGTTGTGATTGCCCTAGGAAGCAATGTGGGCGACAGGCTCCATAATTTTGAGGAGGCGTTGCAGCGGATGAAGAAATCAGACATCCAGATCACACGACATGGCTGCTTGTACGAGACTGAACCTGCCTATGTAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777448.1
MNIIKQVVAVKYGGRAAKTSFEAARLRLFHDAPVEVNSEEQEVVIALGSNVGDRLHNFEEALQRMKKSDIQITRHGCLYETEPAYVTDQPRFLNSAVRATTKLGPHKLLATLKEIERDLGRTAAIRYGPRPIDLDILFYGSRTVNTDTLTIPHERIWERPFVMAPLIDLLGVQPDNETVKSWHTLSRRSGGLFEAWEELGGESLVGKDGMERVLPVGNRLWSWSANTSVMGVLNVTPDSFSDGGKFLSLESAVSRVRSML...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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