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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002941`

染色体: Chr07 坐标: 29798721-29800361 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002941`
名称	SmilChr07G002941
描述	uncharacterized SmilChr07G002941
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	29798721 - 29800361 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994058`
GeneID	`130994058`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994058`
原始查询	`SmilChr07G002941`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Plant transposase (Ptta/En/Spm family) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840721]; symbol=AT1G40087; hit=AT1G40087; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Plant transposase (Ptta/En/Spm family) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840721]; symbol=AT1G40087; hit=AT1G40087; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G40087` (AT1G40087) Plant transposase (Ptta/En/Spm family) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840721] identity=26; qcov=0.501; evalue=7.56e-08; confidence=low
Rice	`Os02g0129000` - identity=28.9; qcov=0.345; evalue=7.83e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994058

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775077.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775077.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775077.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775077.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775077.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:29798880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B52,B92
`Chr7:29798959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr7:29799163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B34,B38,B39,C13,D6
`Chr7:29799165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr7:29799195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C52,C86
`Chr7:29799472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr7:29799669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,C71
`Chr7:29799676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,C1,C13,C42,D1
`Chr7:29799823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr7:29799824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B83,C25,C60,C77
`Chr7:29799834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B88
`Chr7:29799838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B104,B88

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775077.1

391 aa

196

391

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 124-251 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775077.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	124	251	2.9e-24	86.5	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919094.1
AAGGCCATGTGAAACTGACAAGAATGGGAATGAAACCTAGTGATGTTTTCAAGTTGGCTAAAGGTTTGAGAATTTTGGTAAATGTCAATGAACATGGCCAACCGATCTGAGCAGCTAGAAGAGTTCTAACAAGATACATGATGAAACTTGTTAAACAACCAAATCTTTGTTCGCCAGATTTAAATGATTTTAATGATGTTAAACATGCCTTTGGAGTTGAGCTGCTGAGAGCTGTGCGGGAGAAATTCTATATCCCTAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994058
ATGATGAAACTTGTTAAACAACCAAATCTTTGTTCGCCAGATTTAAATGATTTTAATGATGTTAAACATGCCTTTGGAGTTGAGCTGCTGAGAGCTGTGCGGGAGAAATTCTATATCCCTAGACATGAAAATGTGGACAATGTATTAATTGCTCTAATGGGCATAAAATTCAGGAACAACAAGTATCGGATAAGAAAGGAGATATATAAAAAGACACATGCTAGATTGAGGGAAAAGCTGAAAGCAGTTCTGGAAGCTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775077.1
MMKLVKQPNLCSPDLNDFNDVKHAFGVELLRAVREKFYIPRHENVDNVLIALMGIKFRNNKYRIRKEIYKKTHARLREKLKAVLEASGVHGEELEHRVTFHEFREDQILAELDRIEPPPGFANHQWLKFKSNMKSEKAKKLSEKGKKARATQSHTHTTGTKSYAQVEDEHVIKYKEHPGPLTFFDLTHKRRDGSYVQSDSKEFMIAAKSEIVRRKNEGTCENPVELESSVWYDLMGDDKPGRARGYGIGVTKSSLTAFRA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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