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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002951`

染色体: Chr07 坐标: 29914912-29915415 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002951`
名称	SmilChr07G002951
描述	probable carboxylesterase 5
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	29914912 - 29915415 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994063`
GeneID	`130994063`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994063`
原始查询	`SmilChr07G002951`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable carboxylesterase 5
产物	probable carboxylesterase 5
Arabidopsis	`AT1G47480` (AT1G47480) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841155] identity=40.9; qcov=0.952; evalue=6.3e-39; confidence=medium
Rice	`Os06g0214800` (GID1L2) - identity=38.6; qcov=0.946; evalue=3.47e-33; confidence=medium
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00135 (COesterase); PF07859 (Abhydrolase_3); PF20434 (BD-FAE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994063

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057775080.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775080.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775080.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775080.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775080.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:29914960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr7:29914968`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A5,A7,B106,B109,B134,B40,B42,B43,B55,B59,C11,C15,C21,C36,C42,C5,C53,C69,C71,C73,C9,D1,D5,D8
`Chr7:29914972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C67,C69
`Chr7:29914979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C1
`Chr7:29914988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B88,C6,C85
`Chr7:29914990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B30,C11,C69,C71
`Chr7:29915006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B15
`Chr7:29915023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B57
`Chr7:29915037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C50
`Chr7:29915051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B71
`Chr7:29915052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B44,C19,C67,C69
`Chr7:29915149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775080.1

167 aa

167

COesterase

BD-FAE

Abhydrolase_3

PF00135 COesterase 58-115 aa PF20434 BD-FAE 59-140 aa PF07859 Abhydrolase_3 75-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775080.1`	Pfam	`PF00135`	COesterase	Domain	58	115	5.6e-07	29.6	Carboxylesterase family
`XP_057775080.1`	Pfam	`PF20434`	BD-FAE	Domain	59	140	3.3e-09	37.3	BD-FAE
`XP_057775080.1`	Pfam	`PF07859`	Abhydrolase_3	Domain	75	159	2.9e-18	67.1	alpha/beta hydrolase fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919097.1
ATGGCCTCAGGAACTAAAGAAATCGCCGTCGAAATGTTGCCCTATTTCCACCTATTCACCGACGGCACCATTGAGAGGCTTCCTCCGCCACTCAACTCCTCTCCCTCAGACGACCCGGACGCCGCCGTCTGCTCCAAAGATGTCCTCATCGACCCCGACACCGATGTCTCCCTCCATATATTCGCGCCACACCAACGAGCTCCGCCGCAGAAACTCTCCCTCGTCGTCTACATCCACGGCGGCGCTTTCTGCATGGGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994063
ATGGCCTCAGGAACTAAAGAAATCGCCGTCGAAATGTTGCCCTATTTCCACCTATTCACCGACGGCACCATTGAGAGGCTTCCTCCGCCACTCAACTCCTCTCCCTCAGACGACCCGGACGCCGCCGTCTGCTCCAAAGATGTCCTCATCGACCCCGACACCGATGTCTCCCTCCATATATTCGCGCCACACCAACGAGCTCCGCCGCAGAAACTCTCCCTCGTCGTCTACATCCACGGCGGCGCTTTCTGCATGGGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775080.1
MASGTKEIAVEMLPYFHLFTDGTIERLPPPLNSSPSDDPDAAVCSKDVLIDPDTDVSLHIFAPHQRAPPQKLSLVVYIHGGAFCMGASSSPAFHNFISKLVEKGNLIAVSADYGLVPENPLPILFDDTWNAFQWIAAHADGDGTNPWLNEYADFWHVFIRERARGPP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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