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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002952`

染色体: Chr07 坐标: 29928157-29936627 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002952`
名称	SmilChr07G002952
描述	AAA-ATPase At2g46620-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	29928157 - 29936627 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994064`
GeneID	`130994064`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994064`
原始查询	`SmilChr07G002952`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AAA-ATPase At2g46620-like
产物	AAA-ATPase At2g46620-like
Arabidopsis	`AT2G46620` (AT2G46620) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819274] identity=54.5; qcov=0.786; evalue=3.12e-40; confidence=medium
Rice	`Os03g0114400` (OSJNBa0090O10.13) - identity=51.3; qcov=0.621; evalue=5e-32; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0015935 (small ribosomal subunit)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994064

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057775081.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057775081.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057775081.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775081.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775081.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:29928188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr7:29928427`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B25
`Chr7:29928427`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B25
`Chr7:29936272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C71
`Chr7:29936283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr7:29936302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr7:29936303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,B71,B79,B82
`Chr7:29936307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,C31,C56,C62,C63
`Chr7:29936357`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A4,B128,B51,C19,C2,C26,C45,C74
`Chr7:29936360`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A4,B128,B51,C19,C2,C26,C45,C74
`Chr7:29936361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B48,C17,C32,C50
`Chr7:29936403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919098.1
ATGGCGAAGTTTCTAAGCTACGACGTCTACGAGATTAATCTGCACAAGGTGAGAAACGACGCCGATTTGAAGTACCTTCTCCTCCAAACGACGAAGAAGTCGTTGCTCGTGATCGAGGATCTCGACCGTCATTTAGAGGATAAATCGATGGAACTAAGCTTATCCGGAGTCCTCAACCTCAACTTCATGGATGAAATATTCTTCTGCTGCGGCGAGGAGAGAGTCATGGTCTTCACCATGAACAACAAGGAAAACGTCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994064
ATGGCGAAGTTTCTAAGCTACGACGTCTACGAGATTAATCTGCACAAGGTGAGAAACGACGCCGATTTGAAGTACCTTCTCCTCCAAACGACGAAGAAGTCGTTGCTCGTGATCGAGGATCTCGACCGTCATTTAGAGGATAAATCGATGGAACTAAGCTTATCCGGAGTCCTCAACCTCAACTTCATGGATGAAATATTCTTCTGCTGCGGCGAGGAGAGAGTCATGGTCTTCACCATGAACAACAAGGAAAACGTCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775081.1
MAKFLSYDVYEINLHKVRNDADLKYLLLQTTKKSLLVIEDLDRHLEDKSMELSLSGVLNLNFMDEIFFCCGEERVMVFTMNNKENVCASILRPGRIDVHINFPIYDFTAFKNWSGQNLADKVEEGKGFSSAENDPVNSKELNEDLCEVKISFLVTEGRVKDVPGVRYHIVRETLDVVEVNDR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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