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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002955`

染色体: Chr07 坐标: 30017000-30018259 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002955`
名称	SmilChr07G002955
描述	phosphoserine aminotransferase 2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	30017000 - 30018259 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995981`
GeneID	`130995981`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995981`
原始查询	`SmilChr07G002955`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphoserine aminotransferase 2, chloroplastic-like
产物	phosphoserine aminotransferase 2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G17630` (AT2G17630) Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816270] identity=73.7; qcov=1.07; evalue=8.34e-137; confidence=high
Rice	`Os03g0157900` (OJ1134F05.4) - identity=65.3; qcov=1.07; evalue=2.31e-118; confidence=high
GO	GO:0004648 (O-phospho-L-serine:2-oxoglutarate transaminase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006564 (L-serine biosynthetic process); GO:0009570 (chloroplast stroma); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	smil00260 (Glycine, serine and threonine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00750 (Vitamin B6 metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00266 (Aminotran_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995981

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057777497.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057777497.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057777497.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777497.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777497.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:30017201`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	95	A1,A10,A14,A16,A19,A21,A23,A25,A3,A8,B1,B103,B111,B112,B117,B120,B127,B128,B129,B130,B134,B139,B14,B140,B15,B17,B20,B21,B23,B30,B31,B32,B36,B41,B45,B46,B47,B52,B57,B58,B59,B62,B63,B65,B70,B74,B77,B8,B80,B83,B84,B85,B86,B90,B92,B94,B95,B96,B98,C16,C17,C18,C19,C23,C25,C3,C31,C40,C41,C42,C43,C44,C49,C5,C50,C53,C54,C56,C59,C6,C61,C62,C63,C64,C66,C72,C73,C75,C76,C79,C83,C87,C9,D6,D9
`Chr7:30017211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr7:30017212`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A4,B100,B109,B111,B114,B14,B3,B34,B37,B40,B41,B54,B62,B77,B89,C11,C14,C25,C28,C3,C30,C33,C40,C45,C49,C69,C70
`Chr7:30017214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,D8
`Chr7:30017229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,A8,B131,B35,B52
`Chr7:30017238`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B123,B133,B134
`Chr7:30017238`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B123,B133,B134
`Chr7:30017239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,A8,B131,B35,B52
`Chr7:30017241`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	57	A11,A13,A2,A6,A9,B102,B109,B111,B113,B115,B120,B129,B133,B14,B140,B15,B19,B22,B24,B28,B30,B34,B42,B43,B44,B5,B51,B60,B61,B65,B67,B72,B79,B8,B93,B94,B97,B98,C1,C17,C24,C25,C28,C32,C33,C36,C38,C46,C62,C64,C66,C68,C7,C74,C80,D3,D6
`Chr7:30017252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B73,B85
`Chr7:30017270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C35
`Chr7:30017272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B132,B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777497.1

234 aa

117

234

Aminotran_5

PF00266 Aminotran_5 5-126 aa PF00266 Aminotran_5 124-229 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777497.1`	Pfam	`PF00266`	Aminotran_5	Domain	5	126	3e-25	89.7	Aminotransferase class-V
`XP_057777497.1`	Pfam	`PF00266`	Aminotran_5	Domain	124	229	3e-25	89.7	Aminotransferase class-V

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921514.1
GGCCATTTTCACGTTGGGCTCCCTATAGTCGAAGTTGGGTCAACTAAACCCCTATAGTCCATAAAATCGAATATTTGGGCCCCTTGCCCTAACGATAGTTTGACGCCGTCCGTCTTCTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTAATCGGCGGTGAGATTGGAGATCGCCGCCTTCCCCGCCACCCTCTCCTGCCAGACCACCTCTCCCACGAGATCCCTCTCCATCACCTGCTCATCCACAACCCTCCAAACCCCAACATCCGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995981
ATGTCGGTGATGGAGATGAGCCACCGTGGCAAGGAATTCCTCTCCATTATCCAGAAGGCCGAATTAGATCTCCGGACCCTGCTCAACATCCCCTCCGACTACACCGTCCTCTTCCTCCAGGGCGGCGCCACCACGCAGTTCGCCGCCATCCCTCTCAATCTCTGCAACACCGACGACGTCATCGATTACGTCGTCACCGGATCTTGGGGCGACAAGGCCTTCAAAGAGGCCGCCAAGTACTGTAACCCTAAATCGATCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777497.1
MSVMEMSHRGKEFLSIIQKAELDLRTLLNIPSDYTVLFLQGGATTQFAAIPLNLCNTDDVIDYVVTGSWGDKAFKEAAKYCNPKSIWSGKSEKYTKIPNFDSLEQTPGAKYLHICANETIHGXSNFCSKPVDVTKFGMIYAGTQKNVGPSGVTIAIVRSDLIGKSQAITPVMLDNKIHAENNSLYNTPPCYDIYMCGLVFEDLMEQGGLAEVEKKNVKKVGILYDAIDGSKRGI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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