当前解析结果
SmilChr07G002968| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002968 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002968 |
| 描述 | ACT domain-containing protein ACR4-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 30173748 - 30176535 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995947 |
|---|---|
| GeneID | 130995947 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995947 |
| 原始查询 | SmilChr07G002968 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ACT domain-containing protein ACR4-like |
| 产物 | ACT domain-containing protein ACR4-like |
| Arabidopsis | AT1G69040 (ACR4)ACT domain repeat 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843236] identity=75.7; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os03g0413100 (OsACR7)- identity=69.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01842 (ACT); PF13740 (ACT_6); PF26956 (ACT_ACR_D1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995947 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057777451.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057777451.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057777451.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057777451.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057777451.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:30174197 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A19 |
Chr7:30174900 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057777451.1PF26956
ACT_ACR_D1 33-109 aa
PF01842
ACT 127-181 aa
PF13740
ACT_6 129-173 aa
XP_057777453.1PF26956
ACT_ACR_D1 33-109 aa
PF01842
ACT 127-181 aa
PF13740
ACT_6 129-173 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057777451.1 |
Pfam | PF26956 |
ACT_ACR_D1 | Domain | 33 | 109 | 2.1e-50 | 169.2 | ACR family N-terminal ACT domain |
XP_057777451.1 |
Pfam | PF01842 |
ACT | Domain | 127 | 181 | 1.4e-31 | 108.6 | ACT domain |
XP_057777451.1 |
Pfam | PF13740 |
ACT_6 | Domain | 129 | 173 | 4.4e-08 | 33.5 | ACT domain |
XP_057777453.1 |
Pfam | PF26956 |
ACT_ACR_D1 | Domain | 33 | 109 | 2.5e-50 | 169.0 | ACR family N-terminal ACT domain |
XP_057777453.1 |
Pfam | PF01842 |
ACT | Domain | 127 | 181 | 1e-31 | 109.0 | ACT domain |
XP_057777453.1 |
Pfam | PF13740 |
ACT_6 | Domain | 129 | 173 | 4.2e-08 | 33.6 | ACT domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。