当前解析结果
SmilChr07G002971| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002971 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002971 |
| 描述 | cytosolic sulfotransferase 12-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 30268075 - 30269556 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995959 |
|---|---|
| GeneID | 130995959 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995959 |
| 原始查询 | SmilChr07G002971 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cytosolic sulfotransferase 12-like |
| 产物 | cytosolic sulfotransferase 12-like |
| Arabidopsis | AT2G03760 (SOT12)sulfotransferase 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814903] identity=49.9; qcov=0.973; evalue=1.49e-108; confidence=high |
| Rice | Os01g0311600- identity=45.9; qcov=1.01; evalue=4.79e-94; confidence=high |
| GO | GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008146 (sulfotransferase activity); GO:0051923 (sulfation) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00685 (Sulfotransfer_1); PF13469 (Sulfotransfer_3) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995959 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057777470.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057777470.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057777470.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057777470.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057777470.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057777470.1PF00685
Sulfotransfer_1 74-333 aa
PF13469
Sulfotransfer_3 164-259 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057777470.1 |
Pfam | PF00685 |
Sulfotransfer_1 | Domain | 74 | 333 | 6.4e-75 | 252.6 | Sulfotransferase domain |
XP_057777470.1 |
Pfam | PF13469 |
Sulfotransfer_3 | Domain | 164 | 259 | 8.9e-11 | 43.2 | Sulfotransferase family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。