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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002972`

染色体: Chr07 坐标: 30270149-30273066 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002972`
名称	SmilChr07G002972
描述	uncharacterized SmilChr07G002972
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	30270149 - 30273066 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995971`
GeneID	`130995971`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995971`
原始查询	`SmilChr07G002972`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Translin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814905]; symbol=AT2G03780; hit=AT2G03780; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Translin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814905]; symbol=AT2G03780; hit=AT2G03780; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G03780` (AT2G03780) Translin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814905] identity=67.8; qcov=1.01; evalue=6.59e-137; confidence=high
Rice	`Os01g0265900` - identity=73.6; qcov=0.836; evalue=3.86e-130; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0004521 (RNA endonuclease activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF01997 (Translin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995971

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777481.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057777481.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057777481.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057777481.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777481.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:30272682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777481.1

286 aa

143

286

Translin

PF01997 Translin 65-263 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777481.1`	Pfam	`PF01997`	Translin	Family	65	263	2.4e-58	198.2	Translin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921498.1
AATAATAATTTAATATTGAATAATAAAATTATTAGTTCCCTTCTTGAATTATCGAGTGAGAGGACAGATGTTGAATTCGTCGGCCGCGCGTAAGCTCTCTCTAATCGCGCCCAAGCCTCAACGCTTCGCATACTCTGCAGAAATTGTTGGTGCCGCCGCCAAGAAGCCCAGAACTATGACAACCAATGCGGCTGACTCTGACCAAAACTATATGAAGAACGCCTTTTCCAAATACGCTACTTACCTCAACAACCTGAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995971
ATGTTGAATTCGTCGGCCGCGCGTAAGCTCTCTCTAATCGCGCCCAAGCCTCAACGCTTCGCATACTCTGCAGAAATTGTTGGTGCCGCCGCCAAGAAGCCCAGAACTATGACAACCAATGCGGCTGACTCTGACCAAAACTATATGAAGAACGCCTTTTCCAAATACGCTACTTACCTCAACAACCTGAATGACAAGAGAGAAAGGGTGGTAAAAGCTAGCCGGGATATAACTATGAACAGTAAAAAAGTCATATTTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777481.1
MLNSSAARKLSLIAPKPQRFAYSAEIVGAAAKKPRTMTTNAADSDQNYMKNAFSKYATYLNNLNDKRERVVKASRDITMNSKKVIFQVHRISKHNKDEVLQKAENDLAAVMDQYIARLVKELGGTDFWKLRRAYSPGVQEYVEAATLCNFCKTGALLNLDEINASLRTLGDPSNEPLQINVLDYLLGLADLTGELMRMAMGRISDGELEFAQKICRFVREIYRDLTLVAPKMDDPSDMKQKMDVMLQSVMKIENACFSVH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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