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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002973`

染色体: Chr07 坐标: 30278599-30328585 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002973`
名称	SmilChr07G002973
描述	D-aminoacyl-tRNA deacylase
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	30278599 - 30328585 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995955`
GeneID	`130995955`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995955`
原始查询	`SmilChr07G002973`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	D-aminoacyl-tRNA deacylase
产物	D-aminoacyl-tRNA deacylase
Arabidopsis	`AT2G03800` (GEK1) D-aminoacyl-tRNA deacylase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814906] identity=69.2; qcov=1; evalue=3.58e-165; confidence=high
Rice	`Os08g0339200` - identity=65.7; qcov=1; evalue=2.97e-143; confidence=high
GO	GO:0019478 (D-amino acid catabolic process); GO:0051499 (D-aminoacyl-tRNA deacylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF04414 (tRNA_deacylase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995955

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057777464.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057777464.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057777465.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777464.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777464.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:30278619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B137,B71,B84,C60
`Chr7:30278625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B137,B71,C60
`Chr7:30278632`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	77	A13,A15,A18,A2,A21,A25,A6,A8,B102,B105,B11,B112,B114,B118,B134,B135,B136,B139,B140,B16,B17,B18,B20,B23,B24,B3,B30,B31,B37,B42,B43,B49,B53,B56,B58,B61,B67,B68,B69,B70,B73,B76,B88,B90,B91,B92,B95,B96,C12,C13,C18,C21,C25,C30,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C45,C47,C51,C55,C6,C60,C63,C7,C72,C74,C79,C8,C80,C85,C86,C87,D2
`Chr7:30278655`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	B101,B104,B127,B137,B44,B48,B71,C1,C16,C19,C31,C33,C35,C60,D5
`Chr7:30278656`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	15	B101,B104,B127,B137,B44,B48,B71,C1,C16,C19,C31,C33,C35,C60,D5
`Chr7:30278722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C35
`Chr7:30278735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B121,B53,B98,C35
`Chr7:30278745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C7
`Chr7:30278785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B1
`Chr7:30278785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:30278809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:30278817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777464.1

351 aa

176

351

tRNA_deacylase

PF04414 tRNA_deacylase 104-344 aa

XP_057777465.1

318 aa

159

318

tRNA_deacylase

PF04414 tRNA_deacylase 70-311 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777464.1`	Pfam	`PF04414`	tRNA_deacylase	Family	104	344	5e-54	183.6	D-aminoacyl-tRNA deacylase
`XP_057777465.1`	Pfam	`PF04414`	tRNA_deacylase	Family	70	311	3.8e-54	184.1	D-aminoacyl-tRNA deacylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921481.1
CGGAAGTATGAAAGGTGAAACAAGAGCCGTCGGCAAAAACATTTTCACCAAGTTATATAGCGGAAGCCACTTCCACTCCACGCCACCTCTCTCCGCCCTCCGCAAAATGGCGACTTTAGTGGTGGCGACCACCGCTGATCCGGCGTCGATCAACCCGGCCAAAGCCCTTCTCTCCATGCCCGGCTGGCTGCCGGGCCCCACCCTCGACGGCGGGATCAGGAGCTTCAAGAACGGCGACGTCGTTCGTCTATTGCAGCAGG...

XM_057921482.1
AGGTGAAACAAGAGCCGTCGGCAAAAACATTTTCACCAAGTTATATAGCGGAAGCCACTTCCACTCCACGCCACCTCTCTCCGCCCTCCGCAAAATGGCGACTTTAGTGGTGGCGACCACCGCTGATCCGGCGTCGATCAACCCGGCCAAAGCCCTTCTCTCCATGCCCGGCTGGCTGCCGGGCCCCACCCTCGACGGCGGGATCAGGAGCTTCAAGAACGGCGACGTCGTTCGTCTATTGCAGCAGGACAAATTCATAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995955
ATGAAAGGTGAAACAAGAGCCGTCGGCAAAAACATTTTCACCAAGTTATATAGCGGAAGCCACTTCCACTCCACGCCACCTCTCTCCGCCCTCCGCAAAATGGCGACTTTAGTGGTGGCGACCACCGCTGATCCGGCGTCGATCAACCCGGCCAAAGCCCTTCTCTCCATGCCCGGCTGGCTGCCGGGCCCCACCCTCGACGGCGGGATCAGGAGCTTCAAGAACGGCGACGTCGTTCGTCTATTGCAGCAGGACAAATT...

LOC130995955
ATGGCGACTTTAGTGGTGGCGACCACCGCTGATCCGGCGTCGATCAACCCGGCCAAAGCCCTTCTCTCCATGCCCGGCTGGCTGCCGGGCCCCACCCTCGACGGCGGGATCAGGAGCTTCAAGAACGGCGACGTCGTTCGTCTATTGCAGCAGGACAAATTCATAATTGAAGAAGACGACCTCGACTTGAGGTGGGAGGCCGCCACCGGTGAGACTGTGGCGGAGCTCCTCTTTCTTTCCCGCCACGCCGCCGTCTCCAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777464.1
MKGETRAVGKNIFTKLYSGSHFHSTPPLSALRKMATLVVATTADPASINPAKALLSMPGWLPGPTLDGGIRSFKNGDVVRLLQQDKFIIEEDDLDLRWEAATGETVAELLFLSRHAAVSTRPALTIHPIGVPHLKEGDVLPQGGRAGWAAPPCPRIGPWLMLLKKLAESHNLVPEFEITLEATHHGPVTSKPAMFIEIGSTEEYWGREDAAQVIAQLVWEGLGLGASDAVGVWRSTTEKKRVLLGLGGGHYVPRHMDIIQ...

XP_057777465.1
MATLVVATTADPASINPAKALLSMPGWLPGPTLDGGIRSFKNGDVVRLLQQDKFIIEEDDLDLRWEAATGETVAELLFLSRHAAVSTRPALTIHPIGVPHLKEGDVLPQGGRAGWAAPPCPRIGPWLMLLKKLAESHNLVPEFEITLEATHHGPVTSKPAMFIEIGSTEEYWGREDAAQVIAQLVWEGLGLGASDAVGVWRSTTEKKRVLLGLGGGHYVPRHMDIIQKEGTWVGHLISGYSLPMEDPGQTKSSISAESIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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