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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002974`

染色体: Chr07 坐标: 30312797-30316855 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002974`
名称	SmilChr07G002974
描述	uncharacterized SmilChr07G002974
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	30312797 - 30316855 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995938`
GeneID	`130995938`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995938`
原始查询	`SmilChr07G002974`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0467100; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os04g0467100; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G13650` (AT1G13650) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837926] identity=54.9; qcov=0.128; evalue=5.62e-14; confidence=weak
Rice	`Os04g0467100` - identity=54.5; qcov=0.179; evalue=2.03e-15; confidence=weak
GO	GO:0009786 (regulation of asymmetric cell division)
KEGG	-
Pfam	PF31003 (BASL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995938

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057777427.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777427.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777427.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777427.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777427.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:30315124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B84,C44,C78
`Chr7:30315167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:30315336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:30315485`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C61
`Chr7:30315485`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C61
`Chr7:30315521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:30315551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr7:30315861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C70
`Chr7:30315864`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A16,A4,B106,B126,B132,B27,B46,B53,B75,B78,B80,C15,C51,C6,C63,C67
`Chr7:30315867`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	A16,A4,B106,B126,B132,B27,B46,B53,B75,B78,B80,C15,C51,C6,C63,C67
`Chr7:30315963`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B124,B136,B25,B38,B39,B62,B66,C27,C55
`Chr7:30316045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B84,C44,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777427.1

554 aa

277

554

BASL

PF31003 BASL 335-554 aa

XP_057777430.1

554 aa

277

554

BASL

PF31003 BASL 335-554 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777427.1`	Pfam	`PF31003`	BASL	Family	335	554	7e-12	46.6	Breaking of asymmetry in the stomatal lineage protein
`XP_057777430.1`	Pfam	`PF31003`	BASL	Family	335	554	7e-12	46.6	Breaking of asymmetry in the stomatal lineage protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921444.1
ATAACCACAACATAAAACAATAAGTATGCGTAGAGAGAGAAAGTTGACTAAATGTGTGTTGGAAGTGATTGCCTTTTCACTTAAATATTAAAACGCCTCGTACACACAGCACCATCGCAGCTCGCCTTCTCTCTCTCTAGAACTCTCGTCCGAGGATGCGTTTGTCTCTATCTACCTATGATTTTATAGGGGTTATTGTATTTATGCGTATGTGATGCTGTGTCGTGCACCGGGCTGAGATTTCGCCACCATTTTTTTTT...

XM_057921447.1
AATAAGTATGCGTAGAGAGAGAAAGTTGACTAAATGTGTGTTGGAAGTGATTGCCTTTTCACTTAAATATTAAAACGCCTCGTACACACAGCACCATCGCAGCTCGCCTTCTCTCTCTCTAGAACTCTCGTCCGAGGATGCGTTTGTCTCTATCTACCTATGATTTTATAGGGGTTATTGTATTTATGCGTATGTGATGCTGTGTCGTGCACCGGGCTGAGATTTCGCCACCATTTTTTTTTTCGCTTCTACATATAATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130995938
ATGACCATGAAGGAAAATTGGAAAGAAACCACCTTTGATTCAAGATGTTTAGAGAGGGAGACTGATGCCCTAGCATTCGGGAGTAAAGAAAGATACGCGCTAAATGATTCTAAAATGGATGCCAATCTTACAGAAATAGAGGCAAAAGATAGAGATGACTGTTCAAACTTTAAAGTTGCGGATGACTCTTCTATTAATGATGAAAATGGAACGATGGCTTCTCCTTGGAAGGAAGGTCAAAATGGACTCTCACATCATCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777427.1
MTMKENWKETTFDSRCLERETDALAFGSKERYALNDSKMDANLTEIEAKDRDDCSNFKVADDSSINDENGTMASPWKEGQNGLSHHQIIDNGTIDFPRKESKDGQAHHVSSWDKDADSLSSDSFDMEKEQGSPERKSFDTVEELADCNGSVPRDSNSPLFTDKSVLECRLPELEVCYREIDCQILKDICVDEGRPEEDANEIESSIFPLPPNDNDGLEAKEDSSMDADSFTADQCGSKEENDGKKLISMEKTDSCLENAV...

XP_057777430.1
MTMKENWKETTFDSRCLERETDALAFGSKERYALNDSKMDANLTEIEAKDRDDCSNFKVADDSSINDENGTMASPWKEGQNGLSHHQIIDNGTIDFPRKESKDGQAHHVSSWDKDADSLSSDSFDMEKEQGSPERKSFDTVEELADCNGSVPRDSNSPLFTDKSVLECRLPELEVCYREIDCQILKDICVDEGRPEEDANEIESSIFPLPPNDNDGLEAKEDSSMDADSFTADQCGSKEENDGKKLISMEKTDSCLENAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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