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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002993`

染色体: Chr07 坐标: 30598772-30602735 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002993`
名称	SmilChr07G002993
描述	uncharacterized SmilChr07G002993
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	30598772 - 30602735 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994072`
GeneID	`130994072`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994072`
原始查询	`SmilChr07G002993`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3767434]; symbol=AT1G51172; hit=AT1G51172; species=arabidopsis; confidence=low
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3767434]; symbol=AT1G51172; hit=AT1G51172; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G51172` (AT1G51172) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3767434] identity=31.4; qcov=0.374; evalue=6.25e-15; confidence=low
Rice	`Os02g0307900` - identity=33; qcov=0.259; evalue=3.86e-09; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994072

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775091.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775091.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775091.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775091.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775091.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:30601343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,C1,C37
`Chr7:30601437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr7:30601510`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr7:30601510`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B13
`Chr7:30601531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C34
`Chr7:30601547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B90,C23,C27,C52,D11
`Chr7:30601610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,C71,C73
`Chr7:30601620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:30601663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C25
`Chr7:30601666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B122,B35,B49,B50
`Chr7:30601696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B15
`Chr7:30601732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919108.1
AGGTCCAGCCTGTATAATTTGACTTCACAGCTTCTTGAGAAAAGGACAAAGGCAGATCCCCTTTCTTTCTCCTCTCTGGTTCGGCGGAAAGTAAGGAAAAATAGGAGATATCTCTCTCTTCCCATCTTAATCGCTCCATCTACAAATGATGGCGGATCCTCTTGGGTTTTGCAGGCGCGGCTTCATGGTTGCGGCCGTTGGGTGGAGACCGGACAGGAGGCGGCGCCCGTCGCCGGACTATCCGAGGGAGGAGAAGTAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994072
ATGTCTGCCCGTTTTGTGTCGAGTGGGTCGAGTAATGAGAATTCTAGATCGTCGGATGATGACACGGGCTGTCTAGATACTGTAAATGACGTGCCAAGGAATAGGCCCCGAGCCGGGTATGATATGGTTACGTTTGATTATGGGATTGGTGAAAATTTTTCTGGACCGCTTGAAGGAAGTATTCCTGCATACAAGCTGGAAGACGGGGGCCCGAAATCCGTTATAACTTTTGACAAGTTGGATGAACTCCGTGCTGCCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775091.1
MSARFVSSGSSNENSRSSDDDTGCLDTVNDVPRNRPRAGYDMVTFDYGIGENFSGPLEGSIPAYKLEDGGPKSVITFDKLDELRAAYAIPSCASLAAPSDSERPDWLYPGWTVLYECFLQMGARFPLPRLVFEACTHYRIAPGQLVPNVWRTLMAIQVFSELRGVHFSFSEVLQAYSLETHRIDNVRYQFKANRPLVLSLPDSAKKWRSRYFFISNNALGEPRDSIIPQAWEACTCPRRGPTGLAFDSASKIDWFLGFSE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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