同源 qcov 为最佳单个 HSP 在查询序列上的坐标跨度/序列长度;置信度是规则分级,不是已验证的正交关系。

Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及有 accession 序列支持的文献基因名查询;未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr07G002995

染色体: Chr07 坐标: 30664882-30667710 链方向: + 类型: lncRNA

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr07G002995
名称SmilChr07G002995
描述uncharacterized SmilChr07G002995
染色体 / SeqIDChr07 / NC_080393.1
坐标与链方向30664882 - 30667710 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130996018
GeneID130996018
locus_tag-
NCBI NameLOC130996018
原始查询SmilChr07G002995

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation
描述uncharacterized SmilChr07G002995
产物uncharacterized SmilChr07G002995
Arabidopsis-
-
Rice-
-
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130996018

打开注释模块

非零投票定位候选(最多五项)

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五折投票;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,投票比例不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。

亚细胞定位结果正在生成或该基因暂无预测结果。

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XR_009092348.1
GAGGCCCAAGCCCATCACTAAATATTAATCAGCCTTATTAGCGTAAATTAGAGTTAAGGCAGATTAGCTCATCAGATCAACATGTAGCTCTATCACTTTTTAGTCAGCTGCTTCACCAACCGACTTATATCAGTATAAACATGGTGAACTATCGTAATTTCATTTTTCCCCATTCTGCAACCCTACACAAGCAAATACCCATCCAAACACAAATCATTCACAATTCTTCACAGCGGTTTGCTTCCATCATTCACAATTCA...

CDS

0 records

此非编码 RNA 无 CDS 或蛋白序列。

Protein

0 records

此非编码 RNA 无 CDS 或蛋白序列。

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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