当前解析结果
SmilChr07G003003| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003003 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003003 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003003 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 30838038 - 30838700 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994078 |
|---|---|
| GeneID | 130994078 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994078 |
| 原始查询 | SmilChr07G003003 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994078 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.40000 | XP_057775093.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057775093.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057775093.1 |
| 4 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 0.20000 | XP_057775093.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775093.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:30838045 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B109,C65,C71,C73 |
Chr7:30838050 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 35 | A1,A23,A3,A9,B109,B127,B129,B130,B14,B25,B41,B42,B43,B58,B72,B73,B75,B86,C11,C15,C26,C29,C30,C34,C39,C40,C46,C48,C55,C57,C65,C73,C77,D6,D8 |
Chr7:30838065 |
A |
ATG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 14 | B107,B11,B28,B31,B32,B44,B73,B93,C18,C24,C49,C54,C79,C84 |
Chr7:30838068 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D9 |
Chr7:30838080 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B72 |
Chr7:30838081 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C59 |
Chr7:30838085 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B53 |
Chr7:30838162 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A8,B10,D10 |
Chr7:30838164 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A8,B10,B114,C52 |
Chr7:30838170 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C59 |
Chr7:30838179 |
GGC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B85 |
Chr7:30838179 |
GGC |
G |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B85 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。