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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003006`

染色体: Chr07 坐标: 30890655-30893055 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003006`
名称	SmilChr07G003006
描述	uncharacterized SmilChr07G003006
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	30890655 - 30893055 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994080`
GeneID	`130994080`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994080`
原始查询	`SmilChr07G003006`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=ATMG00750; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	hit=ATMG00750; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`ATMG00750` - identity=66.1; qcov=0.26; evalue=1.03e-20; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF17921 (Integrase_H2C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994080

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775095.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775095.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775095.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775095.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775095.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:30890704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,D6
`Chr7:30890706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr7:30890712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B124,C76
`Chr7:30890713`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A21,B114,B2,B44,B48,B72,C12,C44,C54,D5
`Chr7:30890720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A1,B100,B126,B132,B133,B138,B47,B50,C74,D3
`Chr7:30890743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B35,C24
`Chr7:30890786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr7:30890798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr7:30890806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C56
`Chr7:30890821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr7:30890853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A5,B1,B36,B55,B58,B59,B65,B74,B83,B98,B99,C11,C20,C23,C24,C3,C4,C55,C6,C69,C84
`Chr7:30890862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775095.1

215 aa

108

215

Integrase_H2C2

PF17921 Integrase_H2C2 75-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775095.1`	Pfam	`PF17921`	Integrase_H2C2	Domain	75	130	6e-12	46.2	Integrase zinc binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919112.1
GATTGGAGAATCCGATTGAGGGGGATGATCCGAACATGGCCATCAATGAGTCTTTTCCCGATGAGCAGATTTGGGCGGTGCTATTTAAGGATCCATGGTATGCCGATTATAGCAACTACTTGGTTATTGGAGCTCTTCCCGAGGGGTTATCGCACTATCAAAAGAAGAAGTTCCTCCATGATGTCAAGTTTTATTATTGGGAGGATCCTTACCTATACCGGAGGTGCGCCGATGGCTTTATTCGGCGATGTGTTAGGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994080
ATGGCCATCAATGAGTCTTTTCCCGATGAGCAGATTTGGGCGGTGCTATTTAAGGATCCATGGTATGCCGATTATAGCAACTACTTGGTTATTGGAGCTCTTCCCGAGGGGTTATCGCACTATCAAAAGAAGAAGTTCCTCCATGATGTCAAGTTTTATTATTGGGAGGATCCTTACCTATACCGGAGGTGCGCCGATGGCTTTATTCGGCGATGTGTTAGGGAGCATGAATGGCCAAAGATCATTGAGGAGTGCCATAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775095.1
MAINESFPDEQIWAVLFKDPWYADYSNYLVIGALPEGLSHYQKKKFLHDVKFYYWEDPYLYRRCADGFIRRCVREHEWPKIIEECHSSPSGGHFAANRTAMKVNHSGFYWPSIFADCHAFVKSYDRCQRMGNITKRDEMPQNIIVEVELFDVWGIDFMGPFPPSCGFSYILLAVEYVSRWVEAIPTVTNDSKIICDVDCGIDNIHEALYLLKDLA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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