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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003008`

染色体: Chr07 坐标: 30937370-30945104 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003008`
名称	SmilChr07G003008
描述	DNA-directed RNA polymerase 1, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	30937370 - 30945104 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995921`
GeneID	`130995921`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995921`
原始查询	`SmilChr07G003008`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-directed RNA polymerase 1, mitochondrial-like
产物	DNA-directed RNA polymerase 1%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT1G68990` (MGP3) male gametophyte defective 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843232] identity=64; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0246200` (OsRpoTm) - identity=77; qcov=0.877; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003899 (DNA-directed RNA polymerase activity); GO:0006390 (mitochondrial transcription); GO:0034245 (mitochondrial DNA-directed RNA polymerase complex)
KEGG	-
Pfam	PF00940 (RNA_pol); PF14700 (RPOL_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995921

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057777402.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057777402.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777402.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777402.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777402.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:30937637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr7:30937963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:30938023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C71
`Chr7:30938042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:30938062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,A16,B133
`Chr7:30938078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:30938120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr7:30938170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,B88
`Chr7:30938259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr7:30939127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,B75
`Chr7:30939277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr7:30939482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777402.1

979 aa

490

979

RPOL_N

RNA_pol

PF14700 RPOL_N 150-465 aa PF00940 RNA_pol 588-953 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777402.1`	Pfam	`PF14700`	RPOL_N	Domain	150	465	3.1e-87	293.8	DNA-directed RNA polymerase N-terminal
`XP_057777402.1`	Pfam	`PF00940`	RNA_pol	Family	588	953	6.4e-164	546.7	DNA-dependent RNA polymerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921419.1
AAGGGTTTAAGGCGGCCACAGCCTCCGGTTGGTTTCACCTATCCTCCGTTGTACTCTCTTCAAACTAAAATGCCCTATTTTTCGCCATTTTTGGCTCTCGAATGCCTGATTTCCTAATTTAATTTCTCTCTTCAACGAATTGTCATACTGATCACATTTTGTGGTCTCTTTTGCTCGTCAATCCAGTTGATTCACCCATCGCAATATGTGGAGACATCTATCGAAACAGTCCTGTTTGAGAAGATTCAAGATTTTAAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995921
ATGTGGAGACATCTATCGAAACAGTCCTGTTTGAGAAGATTCAAGATTTTAAAAGAATCCCACCCATCAATCAATGCGTTTAGCGCTGTCAAATACTCTCAGAATTCTATCCTTTGTGAAGAGGACATGCAGTTTCAGCCCCAAATCGGTGTAAATACAGGCAGCTCAGGATTGGGTTTTTTCCAAGGTACAATCTTACGACGGGAGCACGATGTGGGCCCTCCTAAATATGGTTTCCCTAGTGATTCTCTTAGATTTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777402.1
MWRHLSKQSCLRRFKILKESHPSINAFSAVKYSQNSILCEEDMQFQPQIGVNTGSSGLGFFQGTILRREHDVGPPKYGFPSDSLRFTRGYAAAAEALVSTSEEEVDEIQELVEELNKEIDAKSPEIQGRRQQQKMVGGMGLGKYNILRRRQIKVETEAWEEAAKEYQELLVDMCEQKLAPNLPYIKSLFLGWFEPLRDAIAAEQDTCQEGKNRAAYAPYFDQLPADMMAVITMHKLMALLMTGGGNGSARVVQAACHIGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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