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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003044`

染色体: Chr07 坐标: 31556424-31557646 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003044`
名称	SmilChr07G003044
描述	protein C2-DOMAIN ABA-RELATED 5-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	31556424 - 31557646 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995988`
GeneID	`130995988`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995988`
原始查询	`SmilChr07G003044`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein C2-DOMAIN ABA-RELATED 5-like
产物	protein C2-DOMAIN ABA-RELATED 5-like
Arabidopsis	`AT1G48590` (AT1G48590) Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841280] identity=57.7; qcov=0.975; evalue=1.16e-64; confidence=high
Rice	`Os02g0327000` (OsGAP1) - identity=52.2; qcov=0.981; evalue=3.46e-56; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995988

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057777504.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057777504.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777504.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777504.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777504.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:31556626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:31556958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr7:31556958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:31556966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B82,C32,C68
`Chr7:31557455`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	44	A10,A18,A24,A4,A6,A9,B101,B106,B129,B22,B36,B37,B44,B50,B54,B64,B66,B67,B69,B72,B83,B89,B90,B92,B97,C1,C19,C31,C35,C44,C46,C57,C58,C6,C67,C69,C70,C75,C79,C83,D1,D10,D11,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777504.1

160 aa

160

PF00168 C2 5-91 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777504.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	5	91	3.1e-24	85.9	C2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921521.1
CAGAATTGAGGAATCACCATCATTTTGTGTGTTAAATATCGTCCTAGGACAGTTGTAATATCTGGTGGTGTCACTGTTGAAATAAATAGTAGCCCCTCAAATTCAATTTGGAGACCACATGCCATATAGTATCCAATTTATTTGCACATGACATTAAATTACAACTTTGAAAGTATCGAAGAATTCAAAAATGGATGGTTTGGGGATTCTTCGTATTCGAGTTGAGCGAGGTATTAACCTTGCTGTGCGCGACACCAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995988
ATGGATGGTTTGGGGATTCTTCGTATTCGAGTTGAGCGAGGTATTAACCTTGCTGTGCGCGACACCAAAACCAGCGATCCTTACGTTGTCGTCGACTGCGCTTCTCAGAAGGTGAAGACTAGAGTTGAGAAAGACAACTGCAACCCGGTTTGGAACGAAGAGTTGACTATATTCATCAAAGACATAAATGCCCCCATCACTCTATCGGTGTACGACCACGACACGTTCACCAAAGATGACAGCATGGGGAGAGCAGAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777504.1
MDGLGILRIRVERGINLAVRDTKTSDPYVVVDCASQKVKTRVEKDNCNPVWNEELTIFIKDINAPITLSVYDHDTFTKDDSMGRAEIDIKRFVECVKMGSQDLADGTQVCRMEASKDNCLSKESCIVWSNGKMVQDMLLRLRDVECGELQLHIEWLHLPN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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