当前解析结果
SmilChr07G003049| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003049 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003049 |
| 描述 | protein BCCIP homolog |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 31791809 - 31795983 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995962 |
|---|---|
| GeneID | 130995962 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995962 |
| 原始查询 | SmilChr07G003049 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein BCCIP homolog |
| 产物 | protein BCCIP homolog |
| Arabidopsis | AT2G44510 (AT2G44510)CDK inhibitor P21 binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819058] identity=54.4; qcov=1.01; evalue=3.4e-113; confidence=high |
| Rice | Os03g0853900- identity=47; qcov=1.06; evalue=3.38e-96; confidence=high |
| GO | GO:0005634 (nucleus) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF13862 (BCCIP) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995962 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057777473.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057777473.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057777473.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057777473.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057777473.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:31793215 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B34 |
Chr7:31794232 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B52 |
Chr7:31794296 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr7:31794770 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B107,B7,B93,C36,C5 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057777473.1PF13862
BCCIP 80-272 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057777473.1 |
Pfam | PF13862 |
BCCIP | Family | 80 | 272 | 1.2e-57 | 195.7 | BCCIP |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。