Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003050`

染色体: Chr07 坐标: 31815943-31816962 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003050`
名称	SmilChr07G003050
描述	uncharacterized SmilChr07G003050
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	31815943 - 31816962 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994095`
GeneID	`130994095`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994095`
原始查询	`SmilChr07G003050`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0587600; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os03g0587600; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0587600` - identity=45.8; qcov=0.142; evalue=2.62e-06; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994095

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775112.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057775112.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775112.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775112.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775112.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:31815950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B56,B69,B96,D11
`Chr7:31815952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr7:31815981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B47,C54,C61
`Chr7:31815983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B122,B136,C18,C39
`Chr7:31815991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr7:31816006`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B66,B8,C7
`Chr7:31816006`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B66,B8,C7
`Chr7:31816013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,C71
`Chr7:31816061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,D1
`Chr7:31816071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,C73,C86
`Chr7:31816123`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A8,B25,B39,B56,B68,C13,C19,C70
`Chr7:31816127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919129.1
ATGGCAAACATAGCCAAACTTGAGTTCATCGCCCTTGACATCTCGGGCAAGAATTACATGTCATGGACTCTTGATGCTGATATTCATCTGATCTCAAGGGGTCTAGGAGAAACTATCAAAGAAGGAAACAAAGCGTCCGACCAGGATCGCGCTAAGGCACTAATATTCCTTCGTCATCACCTTCATGATGACCTTAAGACAGAGTATCTGACTGTCAAAGATCAACAAGAATTGTGGACGAACCTCAAAGAAAGGTTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994095
ATGGCAAACATAGCCAAACTTGAGTTCATCGCCCTTGACATCTCGGGCAAGAATTACATGTCATGGACTCTTGATGCTGATATTCATCTGATCTCAAGGGGTCTAGGAGAAACTATCAAAGAAGGAAACAAAGCGTCCGACCAGGATCGCGCTAAGGCACTAATATTCCTTCGTCATCACCTTCATGATGACCTTAAGACAGAGTATCTGACTGTCAAAGATCAACAAGAATTGTGGACGAACCTCAAAGAAAGGTTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775112.1
MANIAKLEFIALDISGKNYMSWTLDADIHLISRGLGETIKEGNKASDQDRAKALIFLRHHLHDDLKTEYLTVKDQQELWTNLKERFDHQKTVVLPKARYEWMHLRLQDFKSVSAYNSELFRIVSKLKLCGEKISDADMLEKTFSTFHASNVLLQQQYRERGFKKYSELISCLLVAEQNNELLLKNHELRPTGSAALPEANATFNHDNGRGRGNQRGRGRGRGRGYGRGHGRGKPHDATSSNKKHKASNEHNSYKKEGECQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器