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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003052`

染色体: Chr07 坐标: 31837059-31845883 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003052`
名称	SmilChr07G003052
描述	putative clathrin assembly protein At2g01600
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	31837059 - 31845883 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995933`
GeneID	`130995933`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995933`
原始查询	`SmilChr07G003052`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative clathrin assembly protein At2g01600
产物	putative clathrin assembly protein At2g01600
Arabidopsis	`AT2G01600` (AT2G01600) ENTH/ANTH/VHS superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814689] identity=66.8; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0549000` - identity=68; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000149 (SNARE binding); GO:0005545 (1-phosphatidylinositol binding); GO:0005546 (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding); GO:0005905 (clathrin-coated pit); GO:0006900 (vesicle budding from membrane); GO:0030136 (clathrin-coated vesicle); GO:0032050 (clathrin heavy chain binding); GO:0048268 (clathrin coat assembly); GO:0072583 (clathrin-dependent endocytosis)
KEGG	-
Pfam	PF01417 (ENTH); PF07651 (ANTH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995933

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057777424.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057777424.1`
3	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.40000	`XP_057777424.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057777424.1`
5	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.20000	`XP_057777424.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:31837347`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B67
`Chr7:31837347`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B67
`Chr7:31838198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:31842076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr7:31842842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B26,B81,D11
`Chr7:31843187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr7:31843240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr7:31843400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,C73,C86
`Chr7:31843679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C60
`Chr7:31845326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,C11,C67,C69
`Chr7:31845376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr7:31845378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777424.1

564 aa

282

564

ANTH

ENTH

PF07651 ANTH 31-309 aa PF01417 ENTH 32-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777424.1`	Pfam	`PF07651`	ANTH	Repeat	31	309	4.5e-94	315.2	ANTH domain
`XP_057777424.1`	Pfam	`PF01417`	ENTH	Repeat	32	112	2e-05	25.3	ENTH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921441.1
ATGAGGCCACCCAACCCAAAAGAAAAAACCAAGTGAAAAGAAACAGAGGGCCGAACCGCTCAACACCGATAAACAACCCATTTACTCTCTCTCTCTAGTAACAGCAAGAGAGAGAGCGAGAGAGAGAGAGCGAGAGAGAGAGAGGCGCGAATCGGCTTGTCTGGATTTTAAGATTAATAGAAGTGAGAGAAGGCGGAGAAATTTGGGGCGATCTGAAGGGAAATGGGGACACTTCAGACATGGAGAAAAGCATACGGCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995933
ATGGGGACACTTCAGACATGGAGAAAAGCATACGGCGCTCTCAAAGACCAGACTAAAGTCGGTCTTGCCCATGTCAACTCCGATTTCAAGGATGTTGATGTGGCGATCGTGAAGGCTACAAATCATGTGGAGTGTCCTCCGAAGGAGAGACACCTAAGAAAAATTTTGGTTGCGACGTCAGCAATTCGACCTCGTGCTGATGTTGCGTACTGCATACATGCACTTGCAAGAAGATTGGCAAAGACTCATAACTGGACGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777424.1
MGTLQTWRKAYGALKDQTKVGLAHVNSDFKDVDVAIVKATNHVECPPKERHLRKILVATSAIRPRADVAYCIHALARRLAKTHNWTVALKTLIVIHRTLREGDPTFREELLNFHQRGRVLQLSNFKDDSSPIAWDCSAWVRTYALFLEERLECFRILKYDIEAERLPRPAQGEDKGYSRTRDLVSEELLDQLPSLQQLLYRLIGCRPEGAAVNNYVIQYALALVLKESFKIYCAINDGIINLVDKFFEMPRHEAIKALDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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