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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003055`

染色体: Chr07 坐标: 31931249-31934097 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003055`
名称	SmilChr07G003055
描述	uncharacterized SmilChr07G003055
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	31931249 - 31934097 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994097`
GeneID	`130994097`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994097`
原始查询	`SmilChr07G003055`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`ATMG01250` - identity=55.2; qcov=0.085; evalue=5.95e-21; confidence=weak
Rice	`Os06g0484800` - identity=28.7; qcov=0.973; evalue=5.12e-82; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994097

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775115.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057775115.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057775115.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775115.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775115.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:31931300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,B84
`Chr7:31931326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C35
`Chr7:31931343`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B112,C35,D2
`Chr7:31931343`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B112,C35,D2
`Chr7:31931406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B72,C27,C58
`Chr7:31931457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	127	A10,A15,A16,A18,A19,A22,A23,A25,A4,A9,B101,B103,B104,B105,B11,B111,B112,B113,B114,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B125,B126,B129,B13,B132,B133,B134,B135,B136,B138,B14,B15,B16,B17,B18,B21,B22,B25,B28,B31,B34,B36,B38,B39,B41,B42,B43,B47,B48,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B58,B61,B63,B65,B68,B7,B74,B76,B78,B8,B80,B81,B83,B84,B86,B88,B9,B90,B92,B96,B97,B98,C13,C15,C16,C18,C19,C20,C21,C22,C24,C25,C26,C30,C31,C35,C38,C39,C41,C42,C49,C51,C54,C56,C57,C58,C59,C61,C63,C64,C65,C68,C69,C7,C73,C76,C77,C80,C84,C86,C9,D2,D6,D8,D9
`Chr7:31931466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B28,B3,C61
`Chr7:31931500`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	B117,B118,B56,C45,C74,C87,C9,D3
`Chr7:31931503`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B117,B118,B56,C42,C45,C74,C87,C9,D3
`Chr7:31931527`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A13,B117,B118,C45,C87,D3
`Chr7:31931531`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A13,B117,B118,C45,C87,D3
`Chr7:31931562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B72,C27,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775115.1

787 aa

394

787

RVT_1

PF00078 RVT_1 429-664 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775115.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	429	664	1.1e-18	68.6	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919132.1
ATGGAAACCAAACTTTTATTTGTGGAATGGAATCCTATACTACCTCAAATTGGCTACACAAAGTTTGTTGCGGTGGACTGTGATTGTGCGACGGGGGGTCACAAAGGTGGTTTATGTATACTCTGGGCTGATGATATTAAACTCGACGTCAAGTCATCCTCTTTGCACCATATACTTGCATCGATTGATGATGGAATTCATGAGCCTTGGGATTTTTGTGGATTGTATGGGTGGAGTAATACGGAAGAGCACTCTCTTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994097
ATGGAAACCAAACTTTTATTTGTGGAATGGAATCCTATACTACCTCAAATTGGCTACACAAAGTTTGTTGCGGTGGACTGTGATTGTGCGACGGGGGGTCACAAAGGTGGTTTATGTATACTCTGGGCTGATGATATTAAACTCGACGTCAAGTCATCCTCTTTGCACCATATACTTGCATCGATTGATGATGGAATTCATGAGCCTTGGGATTTTTGTGGATTGTATGGGTGGAGTAATACGGAAGAGCACTCTCTTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775115.1
METKLLFVEWNPILPQIGYTKFVAVDCDCATGGHKGGLCILWADDIKLDVKSSSLHHILASIDDGIHEPWDFCGLYGWSNTEEHSLTWDLMRVLKTQVLERWICGGDFNETMYHFEKRGGQIKPDLRLVRFRDVVEECGLSDLGFVGNPFTWNNNQVGEANIMERLDRVLGSDSWIHLFPSFEVSHLLRKSSDHCPVVLCLEKICDERSFRPKPFRFEAMWLKHESFKETCERLWESGGVVKTAEEVKKKIDDIGYALKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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