当前解析结果
SmilChr07G003071| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003071 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003071 |
| 描述 | pectinesterase inhibitor 11-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 32251387 - 32252522 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130995986 |
|---|---|
| GeneID | 130995986 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130995986 |
| 原始查询 | SmilChr07G003071 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | pectinesterase inhibitor 11-like |
| 产物 | pectinesterase inhibitor 11-like |
| Arabidopsis | AT2G01610 (AT2G01610)Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814690] identity=52.7; qcov=0.925; evalue=1.15e-60; confidence=high |
| Rice | Os06g0711800- identity=38.3; qcov=0.831; evalue=5.46e-30; confidence=medium |
| GO | GO:0004857 (enzyme inhibitor activity); GO:0043086 (negative regulation of catalytic activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04043 (PMEI) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130995986 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057777502.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057777502.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057777502.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057777502.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057777502.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:32251684 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B26,B81,C51 |
Chr7:32251756 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B78,D7 |
Chr7:32251761 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr7:32251934 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C37 |
Chr7:32251973 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C32,C68 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057777502.1PF04043
PMEI 37-190 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057777502.1 |
Pfam | PF04043 |
PMEI | Domain | 37 | 190 | 2.4e-38 | 132.5 | Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。