Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003075`

染色体: Chr07 坐标: 32382131-32382676 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003075`
名称	SmilChr07G003075
描述	uncharacterized SmilChr07G003075
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	32382131 - 32382676 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994102`
GeneID	`130994102`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994102`
原始查询	`SmilChr07G003075`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectin methylesterase inhibitor 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820981]; symbol=PMEI2; hit=AT3G17220; species=arabidopsis; confidence=low
产物	pectin methylesterase inhibitor 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820981]; symbol=PMEI2; hit=AT3G17220; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G17220` (PMEI2) pectin methylesterase inhibitor 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820981] identity=28.6; qcov=0.89; evalue=6.7e-11; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0043086 (negative regulation of catalytic activity); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity)
KEGG	-
Pfam	PF04043 (PMEI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994102

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057775119.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775119.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775119.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775119.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775119.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:32382134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,C24,C46
`Chr7:32382141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,C19,D1
`Chr7:32382367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr7:32382374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A2,B112,B12,B99
`Chr7:32382381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr7:32382389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B138
`Chr7:32382389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr7:32382396`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A7,C10
`Chr7:32382396`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A7,C10
`Chr7:32382404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,D11
`Chr7:32382441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B105,C21,C73,C86
`Chr7:32382460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775119.1

181 aa

181

PMEI

PF04043 PMEI 30-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775119.1`	Pfam	`PF04043`	PMEI	Domain	30	172	3.4e-10	41.0	Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919136.1
ATGGTTTCTCCAAAGTATTTCCTCATCTTCACTTTCATTTCCCTAACATCAATCCTCTCTTCAAATCCAAATGCCCAAAAATCACAAAATTTGATTAACAATATTTGCTCTCAAACACTAAACCCATCACAATGTTCGGAATATCTACAACAACTTTATCGCAATGGTGATAGTCTACAAACTCTCACTCAAAAAACAATCCCATACACCTCAAAATTCTTGTTTCTAATCTACGACGAAATTCGTGTACGTGAAATACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994102
ATGGTTTCTCCAAAGTATTTCCTCATCTTCACTTTCATTTCCCTAACATCAATCCTCTCTTCAAATCCAAATGCCCAAAAATCACAAAATTTGATTAACAATATTTGCTCTCAAACACTAAACCCATCACAATGTTCGGAATATCTACAACAACTTTATCGCAATGGTGATAGTCTACAAACTCTCACTCAAAAAACAATCCCATACACCTCAAAATTCTTGTTTCTAATCTACGACGAAATTCGTGTACGTGAAATACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775119.1
MVSPKYFLIFTFISLTSILSSNPNAQKSQNLINNICSQTLNPSQCSEYLQQLYRNGDSLQTLTQKTIPYTSKFLFLIYDEIRVREIQSIKNPTLNKIYHKCGEAYTAATNTVNESQTVLQSGDYQKLLSLASNALNQAQSCSKNFGMGESEPSDFKSLDLKGQNVCSIVLAMSKQLLAGKV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器