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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003082`

染色体: Chr07 坐标: 32479971-32482009 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003082`
名称	SmilChr07G003082
描述	dynein light chain 1, cytoplasmic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	32479971 - 32482009 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996048`
GeneID	`130996048`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996048`
原始查询	`SmilChr07G003082`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dynein light chain 1, cytoplasmic
产物	dynein light chain 1%2C cytoplasmic
Arabidopsis	`AT1G23220` (AT1G23220) Dynein light chain type 1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838931] identity=74.6; qcov=1; evalue=3.63e-66; confidence=high
Rice	`Os02g0580400` - identity=72.3; qcov=0.723; evalue=7.29e-47; confidence=medium
GO	GO:0007017 (microtubule-based process); GO:0030286 (dynein complex); GO:0045505 (dynein intermediate chain binding); GO:0051959 (dynein light intermediate chain binding)
KEGG	smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04517 (IgSF CAM signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04814 (Motor proteins - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01221 (Dynein_light)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996048

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777534.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057777534.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057777534.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777534.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777534.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:32480316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A13,B101,B48,B67,B86,C10,C18,C35,C47,C63,C74
`Chr7:32480462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C44
`Chr7:32481571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B78,D11,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777534.1

130 aa

130

Dynein_light

PF01221 Dynein_light 37-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777534.1`	Pfam	`PF01221`	Dynein_light	Domain	37	123	2.4e-28	99.0	Dynein light chain type 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921551.1
TCCTAAAAAGAACCAAAAGTAATATACACCCAAATTAAGTCATTGTATTCGAGGTTATTGTTTGCACTTTGCAGCAGAGATTTCCTTTTCATGTCTTTTTCTTACATAAACTCAAAACACCTCTTCCAAATACATATTTTCTCTTTCTTGGACACTGTACCAATCAATACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTCTGAGCTTTGACTGACCACATGATTGAAGAAAATAGATGAAAAGATCATCATCATCAGGTTGAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996048
ATGCAGGGAGCAGAAGAAGAGCTGGAGAGGAGAAGCAAGTTCTTGAACAGTTTGATACAGAAGAAGAAGAATGCAGCTGAGCAGAAACAGAATCATGATCGCATGAATGTGCGTGTGAGGGCTTCGGATATGCCTCTGCCTCTGCAGAATCACGCCTTCAAAACTGCTAGAGACATTCTTGATTCCATGGCTTCTGTCAAGCTCGACAGCAAACGCCTTGCTCTTTCCCTTAAAAAGGAGTTCGACTCAACATATGGTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777534.1
MQGAEEELERRSKFLNSLIQKKKNAAEQKQNHDRMNVRVRASDMPLPLQNHAFKTARDILDSMASVKLDSKRLALSLKKEFDSTYGPAWHCIVGSSFGSYVTHSLGGFLYFSIDKVYVLLFKTAVEPLEQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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