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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003086`

染色体: Chr07 坐标: 32581204-32584956 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003086`
名称	SmilChr07G003086
描述	protein TIFY 7
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	32581204 - 32584956 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996049`
GeneID	`130996049`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996049`
原始查询	`SmilChr07G003086`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TIFY 7
产物	protein TIFY 7
Arabidopsis	`AT1G70700` (TIFY7) TIFY domain/Divergent CCT motif family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843407] identity=34.4; qcov=1.03; evalue=7.12e-28; confidence=low
Rice	`Os09g0401300` (OsJAZ8) - identity=37.4; qcov=0.637; evalue=1.13e-18; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0009611 (response to wounding); GO:0031347 (regulation of defense response); GO:2000022 (regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06200 (tify); PF09425 (Jas_motif)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996049

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777535.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777535.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777535.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777535.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057777535.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:32581504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C77
`Chr7:32581531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B45
`Chr7:32582356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr7:32582440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr7:32584574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777535.1

306 aa

153

306

tify

Jas_motif

PF06200 tify 112-143 aa PF09425 Jas_motif 245-270 aa

XP_057777536.1

306 aa

153

306

tify

Jas_motif

PF06200 tify 112-143 aa PF09425 Jas_motif 245-270 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777535.1`	Pfam	`PF06200`	tify	Domain	112	143	2e-19	69.3	tify domain
`XP_057777535.1`	Pfam	`PF09425`	Jas_motif	Motif	245	270	8.8e-14	51.7	Jas motif
`XP_057777536.1`	Pfam	`PF06200`	tify	Domain	112	143	2e-19	69.3	tify domain
`XP_057777536.1`	Pfam	`PF09425`	Jas_motif	Motif	245	270	8.8e-14	51.7	Jas motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921553.1
AAACTCAAAATAAAGAAAAACTGTGTAAACGAAAAAGGTGAGGAAAAATGGAAAATAGTGGAGCACGAAAACACATAAGTCGAGATATATTACACATTACCCACCCCAACTGGAAAATAAAGTTGTATCCTTTCTCTGTGGTGCTATTTACTGCAGTTTTACAACTTTGAACCATTCCTTCACCTCTTTGTTTTGCTTTTTAAAAGGAATTGCGAAGTCGGATTTCGTTCAAGGGAAAGTGCAAAATATTTGATATGGAG...

XM_057921552.1
AAAGAAAAACTGTGTAAACGAAAAAGGTGAGGAAAAATGGAAAATAGTGGAGCACGAAAACACATAAGTCGAGATATATTACACATTACCCACCCCAACTGGAAAATAAAGTTGTATCCTTTCTCTGTGGTGCTATTTACTGCAGTTTTACAACTTTGAACCATTCCTTCACCTCTTTGTTTTGCTTTTTAAAAGGAATTGCGAAGTCGGATTTCGTTCAAGGGAAAGTGCAAAATATTTGGTATCTGTTTCTGTAACTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130996049
ATGGAGAGAGATTTCATGGGGTTGAACCCTAAGGATGCTGCTGTTAAGGAAGAGCTTGTCGAGGGCGGCTGCGAAGAATCTGGATTTGCAAGGAGCTCTAGCGTTCCATGGCCTACAAACAAGGTGTCTGGCCTCCCTCAATTTATGTCTTCGAGGTGCAAACAAGATGAGAAGGCAATGAAGAATGGGCAGCTGGGATATCATATGCATCCACTTTCCATGAAGCCACAATTCCTTGGTGGAAGTACTCATACAGCTCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777535.1
MERDFMGLNPKDAAVKEELVEGGCEESGFARSSSVPWPTNKVSGLPQFMSSRCKQDEKAMKNGQLGYHMHPLSMKPQFLGGSTHTAPHHSLPSADSTAGITEQWINSKASNAPAQLTIFYGGTVCVFDDISPEKAQAIMLLAGNVYVQSMMTQSKVHMQAPASKVPAADQPLANQSMNTPPSSGLPSPMSVSSHPIDQSSVPGTNNNDIKLSKIAGMSTALVNNTEPPRVMSSVAASALMSSAVPQARKASLARFLEKRK...

XP_057777536.1
MERDFMGLNPKDAAVKEELVEGGCEESGFARSSSVPWPTNKVSGLPQFMSSRCKQDEKAMKNGQLGYHMHPLSMKPQFLGGSTHTAPHHSLPSADSTAGITEQWINSKASNAPAQLTIFYGGTVCVFDDISPEKAQAIMLLAGNVYVQSMMTQSKVHMQAPASKVPAADQPLANQSMNTPPSSGLPSPMSVSSHPIDQSSVPGTNNNDIKLSKIAGMSTALVNNTEPPRVMSSVAASALMSSAVPQARKASLARFLEKRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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