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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003089`

染色体: Chr07 坐标: 32615688-32621758 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003089`
名称	SmilChr07G003089
描述	plant UBX domain-containing protein 2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	32615688 - 32621758 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996050`
GeneID	`130996050`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996050`
原始查询	`SmilChr07G003089`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plant UBX domain-containing protein 2
产物	plant UBX domain-containing protein 2
Arabidopsis	`AT2G01650` (PUX2) plant UBX domain-containing protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814694] identity=56.9; qcov=1; evalue=2.42e-175; confidence=high
Rice	`Os09g0401600` - identity=53.3; qcov=0.496; evalue=9.4e-72; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0050832 (defense response to fungus)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF09409 (PUB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996050

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057777537.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057777537.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057777537.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057777537.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777537.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:32615947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B51,C48
`Chr7:32620495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C2,C81
`Chr7:32620777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,D7
`Chr7:32620859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B34,B45,C58
`Chr7:32621153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,C3,C65,C70
`Chr7:32621209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777537.1

462 aa

231

462

PUB

PF09409 PUB 175-249 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777537.1`	Pfam	`PF09409`	PUB	Domain	175	249	1e-20	74.2	PUB domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921554.1
CTCTCACATTGTGACGTGGCAGTAAATAATTGGTTGACCATCAATTTTCAAACCGTGCAAAAGCAAAGACGGTTTTATCGGTTGTTAACGCGGCACTATCTCATTGGCCTTAGTCTTAACGCGGCAACTTAAAATTACTCATTATTTTTCACATTATCATTTTGGCCCCCAAAGACTCGTAAAAATTGTTTTCAACACCCCCACAGCTCTTCATTCAACTCGCATCTCCATAGAATTCTCAGCCTGATTTTTCTCTGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996050
ATGGATGAAGTGAAAGATAAAATGAAGGGGCTGATGAAGAAAGTCAACAACCCCTTCACATCATCTTCATCTGGCAAATTCAAGGGCCAAGGCAGAGTTTTGGGATCTTCCACTACGCCGTCACCGTCGCCGCCGCCACCATCGCAATCAGGGTCGTCTTCATCATCATTGTCTAATTCAAGGCCTTCCCATCCGAAGGCACACACTATTTCCGAGCATAAATCCGAGAGCAGAGAGCCCGGGCCACGGATAAAACCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777537.1
MDEVKDKMKGLMKKVNNPFTSSSSGKFKGQGRVLGSSTTPSPSPPPPSQSGSSSSSLSNSRPSHPKAHTISEHKSESREPGPRIKPKAHEKPENGFDPFESLVTTGKRNPNGYSLKIFECPVCGGGYASEEEVSTHVESCLSRAESGSSNKEADGVLNQLQSCVSTYTSGKPSDGSVEVLIRLLRNVVKEPENAKFRRIRMGNPKIKEAVADVPGGVELLECIGFELKEEGGEMWFVMEEPSKERLGLVKNAVLLLEPKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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