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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003096`

染色体: Chr07 坐标: 32734275-32738051 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003096`
名称	SmilChr07G003096
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1A-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	32734275 - 32738051 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996057`
GeneID	`130996057`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996057`
原始查询	`SmilChr07G003096`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1A-like
产物	ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1A-like
Arabidopsis	`AT1G23260` (MMZ1) MMS ZWEI homologue 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838935] identity=74.2; qcov=1; evalue=3.17e-89; confidence=high
Rice	`Os03g0712300` (OsUEV1A) - identity=80.1; qcov=1.01; evalue=9.84e-92; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006301 (DNA damage tolerance); GO:0070534 (protein K63-linked ubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF00179 (UQ_con)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996057

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057777543.1`
2	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777544.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057777544.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057777544.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777543.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:32734891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B104,B136,C52
`Chr7:32735358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr7:32735359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:32735455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777543.1

200 aa

100

200

UQ_con

PF00179 UQ_con 42-134 aa

XP_057777544.1

159 aa

159

UQ_con

PF00179 UQ_con 42-134 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777543.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	42	134	8.9e-15	55.2	Ubiquitin-conjugating enzyme
`XP_057777544.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	42	134	4.3e-15	56.2	Ubiquitin-conjugating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921561.1
TATCAATTATTGTACTTATTTTTTTAATGATTTGAAAAGAAAATTGAGTACCTTTTTCTTGAAGAGATGATTTGGTTTGGATTCTCGAAAAAAATTAGAAATACAAGTTTGCCCTCTGCTTTTGGGAGATGCGAATTCACATCTTTATTCTTTTCTTGCTATTTATCCTCAAAGATTGCAAAAGGCCCCTGTCCTCAAATGTCATAACATACTCTGACTTCACTTCTCAAACAGTAGAGTAAAGTTGCAGTCTTTGATCA...

XM_057921560.1
TTTGAAAAGAAAATTGAGTACCTTTTTCTTGAAGAGATGATTTGGTTTGGATTCTCGAAAAAAATTAGAAATACAAGTTTGCCCTCTGCTTTTGGGAGATGCGAATTCACATCTTTATTCTTTTCTTGCTATTTATCCTCAAAGATTGCAAAAGGCCCCTGTCCTCAAATGTCATAACATACTCTGACTTCACTTCTCAAACAGTAGAGTAAAGTTGCAGTCTTTGATCATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCAACCCACTAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130996057
ATGGGTTCTGAAGGATCGTCGCAGGTTGTTGTACCAAGGAGCTTCAGGTTATTGGAAGAGCTCGAGAGAGGAGAGAAGGGAATAGGTGATGGAACTGTAAGTTATGGGATGGATGATGCTGATGATGTATACATGCAGTCATGGACAGGAACCATCATCGGTCCTCCTAATACTGTACACGAAGGGCGCATATACCAATTAAAACTATTCTGTGGGAAAGATTATCCAGATAATCCACCAACTGTGAGGTTCCAGACAAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777543.1
MGSEGSSQVVVPRSFRLLEELERGEKGIGDGTVSYGMDDADDVYMQSWTGTIIGPPNTVHEGRIYQLKLFCGKDYPDNPPTVRFQTRINMSCVNLETGVVEPHRFPMLLDWKRECTMEDILIQLKKEMMSPQNRKLSQPPDGPSLLICFFVDELEIYESYSIPLFSCLFPFFALNCGLRDAFSIEMLWIWLFNQRILLKI

XP_057777544.1
MGSEGSSQVVVPRSFRLLEELERGEKGIGDGTVSYGMDDADDVYMQSWTGTIIGPPNTVHEGRIYQLKLFCGKDYPDNPPTVRFQTRINMSCVNLETGVVEPHRFPMLLDWKRECTMEDILIQLKKEMMSPQNRKLSQPPDGNEDARLEKGIIIRCCIL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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