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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003101`

染色体: Chr07 坐标: 32841336-32843269 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003101`
名称	SmilChr07G003101
描述	uncharacterized SmilChr07G003101
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	32841336 - 32843269 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994108`
GeneID	`130994108`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994108`
原始查询	`SmilChr07G003101`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsFbox344; symbol=OsFbox344; hit=Os07g0163200; species=rice; confidence=weak
产物	OsFbox344; symbol=OsFbox344; hit=Os07g0163200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os07g0163200` (OsFbox344) - identity=23.7; qcov=0.893; evalue=6.21e-13; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994108

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775127.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057775127.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775127.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775127.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775127.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:32841631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B43
`Chr7:32841707`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	21	A14,A19,A23,B1,B121,B131,B41,B6,B63,B64,B7,B74,B86,B99,C13,C29,C3,C53,C63,C67,D11
`Chr7:32841711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B65
`Chr7:32841721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr7:32841723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B32,B61
`Chr7:32841741`	`G`	`GT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	20	A18,A3,A7,A9,B1,B127,B17,B30,B35,B80,B82,B85,C16,C18,C33,C34,C35,C4,C40,C70
`Chr7:32841822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A22,B110,B113,B47,B91,C24,C52,C59,C9,D10
`Chr7:32841890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B32,B61,C4
`Chr7:32841901`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B27,C14
`Chr7:32841901`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B27,C14
`Chr7:32841904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B32,C11,C69,C82
`Chr7:32841906`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B27,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775127.1

402 aa

201

402

LRR_At1g61320_AtMIF1

PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 128-401 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775127.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	128	401	5.4e-13	49.8	At1g61320/AtMIF1, LRR domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919144.1
TTGATTTTTTTTTTTTAATTTTTAATTTGTTGGCTTTTACGTTTATATGATAAGAAAGTGAAGTAGAAATTAAAAAGAAATTGCAGAAACCAATTATCTGTATGTGTTCTGCATTGTTGTTGATGTATTATTACTTATTAGGTTGATCGAATTAGCGTGCTACCGAAAGAAGTATTAGGGTTGATATTGTCTTTGTTGACGGCCAAGGAAGATACTGCGACTAGCATACTTTGTCGTTCATGGAGATACTTGTGAGTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994108
ATGGATTTTGATGGCACACAATCATTACGTAAGTTTAATAGATTTATGAAAACTTTTGGATTCACGAATCCATCACTGAGCAAGGCATGTATAGAGCCATTGGAAGAGGAAAGGCGTAAGTTCGTTAGATGGGTTGATCGCATTATAGTGTTGAACCAGTGTTTGGATCATAGGTCCAATCTCGAGGAATTCAAAGTGTATTTCGATTTAATTCAAACTCATAGAGAATGGATTGATGATTGGCTCAGCTATGCTTTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775127.1
MDFDGTQSLRKFNRFMKTFGFTNPSLSKACIEPLEEERRKFVRWVDRIIVLNQCLDHRSNLEEFKVYFDLIQTHREWIDDWLSYAFSRKVERLELSLTCEAWGSDRFHRDSHLCYEFPYKKRNLPNNFEVLKKLCLHLVSVSGEVVQLFLEKCPLLEQVSVCGSQALLSLEIVATFPSIKCLEISLCHKLKSVVLRDSNVVTIKYSGKIIPFVLVNVPLLTQLWIKSLVPGPGRLKDVVGMFSPVLPQIEMLKIYPSLIY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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