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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003104`

染色体: Chr07 坐标: 32870630-32872973 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003104`
名称	SmilChr07G003104
描述	uncharacterized SmilChr07G003104
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	32870630 - 32872973 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996062`
GeneID	`130996062`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996062`
原始查询	`SmilChr07G003104`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os11g0577650; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=31.4; qcov=0.668; evalue=2.04e-16; confidence=low
Rice	`Os11g0577650` - identity=49.6; qcov=0.649; evalue=6.53e-37; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996062

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777553.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057777553.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057777553.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777553.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777553.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:32871418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C18
`Chr7:32871458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B2
`Chr7:32871483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,D5
`Chr7:32871577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C10,C46,C70,D8
`Chr7:32871602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:32871619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr7:32871669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr7:32871675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr7:32871684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B75,C50
`Chr7:32871693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr7:32871695`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B37
`Chr7:32871695`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777553.1

205 aa

102

205

DUF8040

PF26138 DUF8040 70-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777553.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	70	158	1.5e-24	86.4	Domain of unknown function (DUF8040)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921570.1
ATATTATTCAAATTTGAAGCTCTGCTCATTTTCGCAGAGACCCTCCCAAAGCTAGGGCACAATACCATTGTAATTCAGTTCGCGATTGTTTCTACAGGTTCGTTTATTTTTTATTTTTTTATTTTTTGCAATTCTGCATTTTATGAATGTCGCCGGCGTGCGTTTCTGAAATTGCGAGTTACGATTGATAGTTATTGCTAGCGTCTTGATTCTGGGTGTTATTGGTGAAGCTCGTTCAGTTGTTATTTACTACAGTCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996062
ATGGAGTCTGTGAGTAGACAGAAACTACTGTCTAATTTGAGGCGTAGAAACTCGTTTGTGTGTATGGCTGTTGAGGAGTTATTGCAGGAACAATTGTTGCAGCTAGTGGTTGTGGTTGATTGCATAGAGAAGTCTAGGTCACGAAAAAGAAAACGTCGGGTATTGGCTGAGCCTTATGGGATGCTCCATAGAATACCTGACCAAGTTAAGTACTTGAATAGGATGATAGACTTTAGTGATACGAATTGTATCATAAACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777553.1
MESVSRQKLLSNLRRRNSFVCMAVEELLQEQLLQLVVVVDCIEKSRSRKRKRRVLAEPYGMLHRIPDQVKYLNRMIDFSDTNCIINLRMDRNTFGRLVQLLRYLGGLKDGRHVTVEEQVAMFLSVLAHHKKNRVVKFNFWRSGQTVSHYIHVVLRAILSLHVQLLVKPTLVLANSDDSRWKWFKGCLGALDETYINVMVPNSDKP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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